大鰭鳠（Mystus macropterus Bleeker）遺傳多樣性及其線粒體控制區(qū)結(jié)構的研究.pdf

1、大鰭鳠(Mystus macropterus Bleeker)，屬鯰形目(Siluriformes)鲿科(Bagridae)鳠屬(Mystus Scopoli)。分布于長江和珠江水系，為我國特有經(jīng)濟魚類，具有肉質(zhì)細嫩、骨刺少、味道鮮美、經(jīng)濟價值高的優(yōu)點。目前，對大鰭鳠的研究主要集中在形態(tài)學、繁殖生物學、池塘馴化、養(yǎng)殖技術以及能量學上的研究，對其種質(zhì)資源狀況、遺傳多樣性現(xiàn)狀和線粒體控制區(qū)結(jié)構方面的研究還比較薄弱。近年來，由于長江干流大型水

2、電樞紐工程，如葛洲壩、三峽大壩等的建成，引起了許多學者對三峽庫區(qū)魚類種質(zhì)資源狀況的研究，但是對大鰭鳠的研究甚少，大壩的建成可能造成其生活環(huán)境的改變、產(chǎn)卵場地的破壞以及生殖隔離的產(chǎn)生，這些是否使大鰭鳠遺傳結(jié)構及多樣性現(xiàn)狀也受到了一定的影響是一個值得深入研究探討的問題。因此，從DNA分子水平對大鰭鳠種群遺傳結(jié)構及基因多樣性狀況進行研究是很有必要的。 本文采用RAPD分子標記方法對長江流域(合川、廣元、岳陽和金口)四個不同江段采集的野

3、生大鰭鳠遺傳多樣性和種群遺傳結(jié)構方面進行研究。研究表明：從16條引物產(chǎn)生的譜帶中，總共獲得139個位點，多態(tài)位點101個，多態(tài)位點百分率為72.66％。具體到每一群體，其多態(tài)位點比率為23.74％～39.57％，可見每一群體內(nèi)的多態(tài)位點比率低于4個群體整體的多態(tài)位點比率：大鰭鳠群體內(nèi)遺傳多樣性指數(shù)分別為：2.2237、1.9689、1.9356、1.0770，即岳陽群體最大，金口群體次之，合川群體再次之，廣元群體最?。黄銷ei比Shan

4、non估算的大鰭鯪群體的遺傳變異指數(shù)低，但其遺傳變異分布趨勢基本上是一致的，即YY＞JK＞HC＞GY(岳陽＞金口＞合川＞廣元)，這一結(jié)果顯示了4個群體遺傳多樣性及地理分布的差異狀況，岳陽江段處于長江中游，上下游群體間基因交流頻繁，且岳陽江段又與洞庭湖等湖泊相連，使得該處的大鰭鳠群體內(nèi)交流機率較其他流域高出許多，而廣元位于長江上游的支流，群體間的基因交流較少，故其多樣性指標較低；大鰭鳠四個群體遺傳相似度和遺傳距離研究表明：大鰭鳠群體間的遺

5、傳相似度的變化范圍為：0.7490～0.9678，岳陽群體和廣元群體遺傳相似度最低為0.7490，岳陽群體和金口群體相似度最高為0.9678；同時，岳剛?cè)后w和金口群體的遺傳距離最小，廣元群體和岳陽群體的遺傳距離最大，分別為0.1015和0.2890，這與UPGMA聚類圖顯示的結(jié)果一致，金口群體和岳陽群體首先聚類，然后聚類的是合川群體和廣元群體，最后，這兩個類群再聚類；遺傳分化系數(shù)Gst為0.4053，即40.53％的遺傳分化發(fā)生在群體之

6、間，有59.47％的遺傳分化發(fā)生在群體內(nèi)。本文還對大鰭鳠線粒體控制區(qū)序列進行了擴增，通過與已發(fā)表的長吻鮠(Leiocassis longirostris)、圓尾擬鲿(Pseudobagrus tenuis)和光澤黃顙(Pelteobagrus nitidus)mtDNA控制區(qū)序列進行比較分析，發(fā)現(xiàn)大鰭鳠線粒體控制區(qū)序列有A、T含量高，G含量低的特點。同時，大鰭鳠線粒體控制區(qū)包括三個主要識別區(qū)域：擴展終止相關序列(extended ter

7、minal associated sequence ETAS)、中央保守序列(Certrol conserved sequence block)、保守序列(Conserved sequence block)。其ETAS序列為：TACATTAATGTGCTATGGTATAGT；中央保守序列中的CSB-F的序列為：ATGTAGTAAGAAACCACCAACCCTCAAT，CSB-E序列為：AGGGCAATAATAGTGGGG，在鲿科魚類中的

8、普遍序列為：AGGGCAA-A-T-GTGGGG，含有GTGGG-box的穩(wěn)定結(jié)構，CSB-D的序列為：TATTACTGGCATCTGGTTCCTA：保守序列中CSB-1的序列為：ATATAATGCATGTTTTAATAACATA，CSB-2序列較易識別，為TAAACCCCCCTACCCCC，CSB-3為：TGTTAAACCCCTAAACCAG。大鰭鳠在不同的種屬間存在大致相同的保守區(qū)段：ETAS結(jié)構、CSB-D、CSB-F、CSB-E