基于網(wǎng)格的生物數(shù)據(jù)管理與訪問服務(wù)研究.pdf

1、隨著生物學(xué)研究在分子水平的展開，尤其是人類基因組計劃的實施完成，產(chǎn)生了海量的生物數(shù)據(jù)，并形成了數(shù)以百計的生物數(shù)據(jù)庫。這些生物數(shù)據(jù)后面隱藏著大量的生物學(xué)知識，如何有效地組織與管理生物數(shù)據(jù)，并從這些數(shù)據(jù)庫中分析并挖掘出有用的信息是進(jìn)行現(xiàn)代生物學(xué)研究的前提和關(guān)鍵。
　　由于我國生物數(shù)據(jù)的物理分散性、地域發(fā)展不均衡性、數(shù)據(jù)異構(gòu)性以及網(wǎng)絡(luò)環(huán)境的不穩(wěn)定性等因素，采用網(wǎng)格技術(shù)解決生物數(shù)據(jù)共享成為了必然的選擇。本文重點研究基于元數(shù)據(jù)的生物數(shù)據(jù)網(wǎng)格

2、中數(shù)據(jù)組織與訪問技術(shù)。
　　首先，根據(jù)生物數(shù)據(jù)的特征，對生物數(shù)據(jù)進(jìn)行抽象，建立生物數(shù)據(jù)分類方法。該方法對所有的生物數(shù)據(jù)劃分成五類，并對各類進(jìn)行多層劃分，這使得每個生物數(shù)據(jù)庫都能在統(tǒng)一的分類方法下進(jìn)行唯一定位。在此基礎(chǔ)上，定義生物數(shù)據(jù)網(wǎng)格中的元數(shù)據(jù)，設(shè)計兩層結(jié)構(gòu)的分布式元數(shù)據(jù)組織和管理模型，實現(xiàn)了對元數(shù)據(jù)的組織和管理，為網(wǎng)格數(shù)據(jù)資源的管理和訪問奠定了基礎(chǔ)。
　　其次，為實現(xiàn)生物數(shù)據(jù)的透明訪問，在數(shù)據(jù)資源目錄的基礎(chǔ)上，設(shè)計了基于

3、元數(shù)據(jù)的生物數(shù)據(jù)訪問模型。構(gòu)造了兩層結(jié)構(gòu)的數(shù)據(jù)訪問中間件。其中，數(shù)據(jù)操作活動層定義了數(shù)據(jù)統(tǒng)一訪問機制，網(wǎng)格數(shù)據(jù)服務(wù)層設(shè)計了統(tǒng)一的網(wǎng)格數(shù)據(jù)訪問服務(wù)接口。在提供數(shù)據(jù)訪問服務(wù)的同時，確保了該中間件和網(wǎng)格環(huán)境的無縫集成。
　　最后，基于以上的邏輯設(shè)計，制定了元數(shù)據(jù)目錄文檔，建立了元數(shù)據(jù)的發(fā)布、更新與發(fā)現(xiàn)服務(wù)，從而完成了元數(shù)據(jù)組織與管理模型的構(gòu)建。另外，建立了網(wǎng)格數(shù)據(jù)服務(wù)，封裝了數(shù)據(jù)操作活動，從而完成了數(shù)據(jù)訪問中間件的構(gòu)建。最終實現(xiàn)了基于網(wǎng)