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文檔簡介
1、鳶烏賊由于生物量巨大、對捕撈壓力的耐受性強,被認為是南海大洋性漁業(yè)資源中最具開發(fā)潛力的種類。
目前南海鳶烏賊的基礎生物學信息仍非常缺乏,尤其是其種群遺傳結構信息的缺失,給“管理單元劃分”等鳶烏賊資源開發(fā)措施的制定帶來了很大的困難。
因此,本研究選用微衛(wèi)星分子標記,在南海采集鳶烏賊地理群體樣品,對南海鳶烏賊的種群結構進行了細致的分析。
本研究主要包括兩部分內(nèi)容:鳶烏賊微衛(wèi)星標記的開發(fā)和南海鳶烏賊的種群遺傳結構
2、分析。
?。?)鳶烏賊微衛(wèi)星標記的開發(fā)
首先通過“磁珠富集法”構建南海鳶烏賊的微衛(wèi)星片段富集文庫,經(jīng)過篩選獲得200個含有微衛(wèi)星片段的陽性克隆子。對其測序后設計出153對引物。然后,使用一個采自南海美濟礁附近海域的鳶烏賊群體(樣本量48)對上述引物進行篩選。最終獲得擴增穩(wěn)定性好、特異性強且多態(tài)性豐富的21個微衛(wèi)星標記。其等位基因數(shù)的分布范圍為6-32,平均值為15.952;表觀雜合度的分布范圍為0.188-0.890,
3、平均值為0.666;期望雜合度的分布范圍為0.322-0.964,平均為0.830;全部標記無連鎖不平衡現(xiàn)象存在,有5個標記背離“哈迪—溫伯格”平衡,4個標記可能含有零等位基因。
?。?)南海鳶烏賊的種群遺傳結構分析
從上述標記中篩選出遺傳屬性優(yōu)秀的12個微衛(wèi)星標記,對南海鳶烏賊6個地理群體進行等位基因分型,以獲取南海鳶烏賊的遺傳多樣性信息。其結果是,在6個不同地理群體中總共檢測出181個等位基因,微衛(wèi)星標記的等位基因
4、平均數(shù)值為15.08,分布范圍為5-22;在所有“群體—標記”組合中,表觀雜合度的分布范圍為0.354-0.875;期望雜合度的分布范圍為0.401-0.946;各群體平均表觀雜合度的分布范圍為0.652(南沙群島中部)-0.698(南沙群島南部);期望雜合度的分布范圍為0.769(南沙群島中部)-0.846(南沙群島南部);在總共69個“群體—標記”組合中,在經(jīng)過“Sequential Bonferroni”校正后,有3個組合背離“哈
5、迪—溫伯格”平衡(校正P值≤0.00417)。
對南海鳶烏賊的種群遺傳結構進行分析,遺傳分歧分析結果表明,絕大部分的遺傳差異(99.61%)位于地理群體內(nèi)部,僅有少量(0.39%)位于地理群體間,整體固定指數(shù)(Overall FST)為0.391。多維尺度分析結果顯示,6個地理群體在2維圖上分布比較分散且地理群體間無聚類現(xiàn)象,表明6個地理群體間的遺傳距離與實際地理無明顯關系。地理距離隔離檢測結果表明,南海鳶烏賊群體對間遺傳關系
6、與地理距離間不存在顯著的相關性(r=0.0696,P=0.605)。個體分配分析表明,種群數(shù)K設定為2時,中沙群島東部群體中80.8%的個體被分配到假設種群1,在南沙群島南部群體中75.9%的個體被分配到假設種群2。其余四個種群的個體在假設種群1和假設種群2中分配比例比較均衡,當種群數(shù)K設定為3時,各地理群體的個體在3個假定種群中的分布比較均勻,未能明確地闡明南海鳶烏賊的種群分布狀況。從整體上看,在南海海域范圍內(nèi)存在著兩個鳶烏賊種群,這
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