DNA修復(fù)基因多態(tài)性與肺癌遺傳易感性的相關(guān)性研究.pdf

1、在所有癌癥中，肺癌導(dǎo)致死亡人數(shù)最多。來(lái)自外源性環(huán)境有害物質(zhì)暴露或內(nèi)源性原因的各種損傷可能導(dǎo)致癌發(fā)生.多種DNA修復(fù)基因存在單核苷酸多態(tài)性。因此深入探討DNA修復(fù)基因多態(tài)性與肺癌易感性之間的關(guān)系是十分必要的。我們的研究首先針對(duì)兩個(gè)重要修復(fù)通路BER途徑的核心基因XRCC1和NER途徑的3個(gè)核心基因XPA，XPC和XPD，參考HapMap數(shù)據(jù)庫(kù)中提供的中國(guó)人的數(shù)據(jù)，運(yùn)用連鎖不平衡分析挑選了13個(gè)標(biāo)簽SNPs，采用病例-對(duì)照方法，用Taqma

2、n探針基因分型技術(shù)檢測(cè)了251例肺癌患者和301例性別，年齡匹配的健康對(duì)照的上述標(biāo)簽SNPs的基因型，最終成功獲得11個(gè)標(biāo)簽SNPs的分型數(shù)據(jù)。從單個(gè)SNP位點(diǎn)，多個(gè)SNP位點(diǎn)聯(lián)合，單個(gè)基因的多個(gè)SNP位點(diǎn)組成的單體型多方面考察了DNA基因變異與肺癌遺傳易感性的關(guān)系。另外，還研究了多個(gè)位點(diǎn)之間，位點(diǎn)與吸煙暴露之間的交互作用對(duì)肺癌發(fā)生的作用。推斷了肺癌的風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測(cè)模型。其次針對(duì)NER途徑的3個(gè)核心基因XPA，XPC，XPD的6個(gè)常見潛在功能

3、性位點(diǎn)與肺癌的相關(guān)性作了Meta分析。本研究觀察到：
　　 1、XRCC1基因rs25487位點(diǎn)GG AG，AA基因型在肺癌組和對(duì)照組中分布頻率分別為56.6％、37.8％、5.6％和48.2％、41.9％、10.0％。分布頻率在兩組間比較無(wú)顯著性差異（P=0.057）。
　　 2、≥60y者，攜帶rs25487 AG基因型及A基因型的個(gè)體較攜帶GG基因型的個(gè)體患肺癌風(fēng)險(xiǎn)分別降低48％和47％（95％CI：0.288-0

4、.922，P=0.026；95％CI：0.308-0.917，P=0.023.respectively）。
　　 3、XRCC1基因rs1799787位點(diǎn)CC，CT，TT基因型在肺癌組和對(duì)照組中分布頻率分別為55.0％、35.9％、9.2％和51.5％、39.5％、9.0％。分布頻率在兩組間比較無(wú)顯著性差異（P=0.668）。
　　 4、XRCC1基因rs3213334位點(diǎn)CC，CT，TT基因型在肺癌組和對(duì)照組中分布頻率

5、分別為82.1％、17.5％、0.4％和80.7％、18.3％、1.0％。分布頻率在兩組間比較無(wú)顯著性差異（P=0.687）。
　　 5、XRCC1（rs25487-rs1799782-rs3213334）最常見的單體型是ACC，其次是GCC和GTC。
　　 6、XRCC1（rs25487-rs1799782-rs3213334）單體型ACC，GCC，GTC和其他型在肺癌組和對(duì)照組中分布頻率分別是24.3％、39.4％、

6、26.9％、9.4％和30.7％、30.6％、、26.9％、10.3％。分布頻率在兩組間比較有顯著性差異（P=0.013）。
　　 7、攜帶XRCC1基因GCC單體型的個(gè)體較攜帶XRCC1基因ACC單體型的個(gè)體肺癌的風(fēng)險(xiǎn)增加63％（95％CI:1.17-2.28：P=0.004）。
　　 8、XPA基因rs2808668位點(diǎn)CC，CT，TT基因型在肺癌組和對(duì)照組中分布頻率分別為19.5％、56.6％、23.9％和30.9

7、％、46.2％、22.9％。分布頻率在兩組間比較有顯著性差異（P=0.007）。
　　 9、攜帶rs2808668 CT基因型及T基因的個(gè)體比攜帶CC基因型的個(gè)體肺癌風(fēng)險(xiǎn)分別增加77％和66％（95％CI:1.12-2.80.P=0.014；95％CI:1.08-2.55.P=0.022respectively）。
　　 10、攜帶rs2808668 CT基因型及T基因的個(gè)體較攜帶CC基因型的個(gè)體肺鱗癌風(fēng)險(xiǎn)分別增加1.1

8、1倍和1.086倍（95％CI:1.065-4.179；P=0.032；95％CI:1.085-4.013，P=0.028.respectively）。
　　 11、<60y者，攜帶rs2808668 CT，TT基因型及T基因的個(gè)體肺癌較攜帶CC基因型的個(gè)體肺癌風(fēng)險(xiǎn)分別升高1.26倍，1.18倍及1.23倍（95％CI:1.184-4.298；P=0.013；95％CI:1.010-4.709；P=0.047；95％CI:1.2

9、10-4.119；P=0.01 respectively）。
　　 12、男性中，攜帶rs2808668 CT基因型的個(gè)體較攜帶CC基因型的個(gè)體患肺癌風(fēng)險(xiǎn)增加76％（95％CI:1.014-3.063.P=0.044）。
　　 13、不吸煙者中，攜帶rs2808668 CT，TT基因型及T基因的個(gè)體肺癌較攜帶CC基因型的個(gè)體肺癌風(fēng)險(xiǎn)分別升高1.23倍，1.03倍及1.17倍（95％CI:1.153-4.320；P=0.0

10、17；95％CI：0.942-4.384；P=0.071；95％CI:1.156-4.058，P=0.016.respectively）。
　　 14、XPA基因rs3176720位點(diǎn)AA，AC，CC基因型在肺癌組和對(duì)照組中分布頻率分別為80.5％、19.1％、0.4％和83.1％、15.9％、1.0％。分布頻率在兩組間比較無(wú)顯著性差異（P=0.613）。
　　 15、肺癌病人中XPA（ra3176720-rs28086

11、68）最常見單體型是AC，其次是AT，CT。
　　 16、XPA（rs3176720-rs2808668）單體型AC，AT，CT在肺癌組和對(duì)照組中分布頻率分別是47.8％、42.2％、10.0％和54.0％37.0％、9.0％。分布頻率在兩組問(wèn)比較無(wú)顯著性差異（P=0.123）。
　　 17、XPC基因rs2733533位點(diǎn)CC，AC，AA基因型在肺癌組和對(duì)照組中分布頻率分別為85.7％、14.3％、0.0％和94.0％

12、、6.0％、0.0％。分布頻率在兩組間比較有顯著性差異（P=0.001）。
　　 18、攜帶rs2733533 A基因的個(gè)體較攜帶CC基因型的個(gè)體患肺癌風(fēng)險(xiǎn)增加1.48倍（95％CI:1.29-4.76；P=-0.006）。
　　 19、攜帶rs2733533 A基因的個(gè)體較攜帶CC基因型的個(gè)體患肺鱗癌風(fēng)險(xiǎn)增加1.61倍（95％CI:1.144-5.965，P=0.023）。
　　 20、<60y者，攜帶rs27

13、33533 A基因的個(gè)體較攜帶CC基因型的個(gè)體肺癌風(fēng)險(xiǎn)增加5.44倍（95％CI：2.127-19.518；P=0.001）。
　　 21、男性中，攜帶rs2733533A基因的個(gè)體較攜帶CC基因型的個(gè)體肺癌風(fēng)險(xiǎn)增加1.72倍（95％CI:1.244-5.967，P=0.012）。
　　 22、不吸煙者中，攜帶rs2733533 A基因的個(gè)體較攜帶CC基因型的個(gè)體肺癌風(fēng)險(xiǎn)增加4.8倍（95％CI:1.721-19.546

14、；P=0.005）。
　　 23、XPC基因rs2228001位點(diǎn)，AA，AC，CC基因型在肺癌組和對(duì)照組中分布頻率分別為38.2％、46.2％、15.5％和37.5％、45.5％、16.9％。分布頻率在兩組間比較無(wú)顯著性差異（P=0.906）。
　　 24、XPC基因rs2229090位點(diǎn)，CC，CG GG基因型在肺癌組和對(duì)照組中分布頻率分別為46.2％、43.4％、10.4％和50.5％、37.9％、11.9％。分布

15、頻率在兩組間比較無(wú)顯著性差異（P=0.415）。
　　 25、女性中，攜帶rs2229090 CG基因型的個(gè)體較攜帶CC基因型的個(gè)體肺癌風(fēng)險(xiǎn)增加1.72倍（95％CI:1.334-5.536，P=0.006）。
　　 26.XPC基因rs3729584位點(diǎn)，GG，GA，AA基因型在肺癌組和對(duì)照組中分布頻率分別為53.8％、38.2％、8.O％和48.8％、41.9％、9.3％。分布頻率在兩組間比較無(wú)顯著性差異（P=0.5

16、01）。
　　 27、女性中，攜帶rs3729584AG基因型及A等位基因的個(gè)體較攜帶GG基因型的個(gè)體肺癌風(fēng)險(xiǎn)分別降低63％和65％（95％CI：0.178-0.773，P=0.008；95％CI：0.175-0.707，P=0.003，respectively）。
　　 28、XPC（rs2229090-rs2228001-rs2733533-rs3729584）最常見單體型是CCCG，其次是CACA，GACG。

17、>　　 29、XPC（rs2229090-rs2228001-rs2733533-rs3729584）單體型CCCG，CACA，GACG和其他型在肺癌組和對(duì)照組中分布頻率分別是34.1％、26.9％、26.7％、12.4％和35.0％、30.1％、、25.9％、9.0％。分布頻率在兩組間比較無(wú)顯著性差異（P=0.253）。
　　 結(jié)論：（1）不同DNA修復(fù)基因多態(tài)性與肺癌易感性高低不同，其中XRCC1基因（rs25487-rs

18、1799782-rs3213334）GCC單體型、XPArs2808668 CT基因型和T等位基因、XPC基因rs2733533位點(diǎn)A等位基因、XPD基因rs1799787位點(diǎn)CT基因型增加肺癌風(fēng)險(xiǎn)。（2）XRCC1，XPA，XPC，XPD基因SNPs和吸煙暴露與肺癌發(fā)生中具有交互作用；（3）Meta分析顯示：XPCA939C位點(diǎn)CC基因型增加總體人群肺癌風(fēng)險(xiǎn)；XPD A751C位點(diǎn)CC基因型及C基因增加總體人群，高加索人群肺癌風(fēng)險(xiǎn)；X