淋巴囊腫病毒中國分離株（LCDV-cn）系統(tǒng)關(guān)系分析與功能基因研究.pdf

1、中國海洋大學(xué)博士學(xué)位論文淋巴囊腫病毒中國分離株（LCDVcn）系統(tǒng)關(guān)系分析與功能基因研究姓名：閆秀英申請學(xué)位級別：博士專業(yè)：海洋生物學(xué)指導(dǎo)教師：孫修勤20080601淋巴囊腫病毒中國分離株(LCDvc11)系統(tǒng)關(guān)系分析與功能基因研究曹魚分離株(LCDVrc)的系統(tǒng)關(guān)系。結(jié)果表明，LCDVcn的mcp基因序列與LCDVC的mcp基因序列是一致的，構(gòu)建的淋巴囊腫病毒ML、NJ、MP和Bayesian系統(tǒng)樹的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)也一致，LCDVrc與LC

2、DVsb聚為一支；LCDVcn與LCDVojf聚為一支；LCDV1獨為一支；LCDVrf也獨為一支。在對35種虹彩病毒的系統(tǒng)關(guān)系分析中，LCDVcn與其他淋巴囊腫病毒分離株聚為一大支，說明LCDVcn與淋巴囊腫病毒的關(guān)系近于其他虹彩病毒。遺傳距離和系統(tǒng)關(guān)系分析認(rèn)為，LCDV1屬于基因型I型，LCDVcn和LCDVjf屬于基因型II型，LCDVrf屬于基因型Ⅲ型，LCDVrc和LCDVsb屬于基因型Ⅳ型。本研究經(jīng)PCR擴增、克隆和測序，證

3、明了獲得的11個LCDVcn的基因DNA序列與已登陸的LCDVC相應(yīng)序列一致。據(jù)此，本研究以LCDVC基因組序列為參考序列進(jìn)行分析，結(jié)果表明，LCDVcn基因組中有119個ORF與其它虹彩病毒無同源區(qū)域、是LCDV特有的；而LCDVcn還有52個自身特有的、含有功能結(jié)構(gòu)或重復(fù)序列的ORF，該52個ORF與其他淋巴囊腫病毒和LCDV無同源區(qū)域。鋅指蛋白在基因的表達(dá)調(diào)控、細(xì)胞分化、胚胎發(fā)育及疾病的發(fā)生等生命過程中發(fā)揮重要作用。本文通過PCR

4、法從LCDVcn基因組餅姐中獲得了鋅指蛋白基因序列，將DNA序列裝入pET24a()表達(dá)載體，在Ecoli中進(jìn)行蛋白表達(dá)并獲得成功。生物信息學(xué)軟件分析表明：Icn61編碼的鋅指蛋白含有4個C2H2型鋅指結(jié)構(gòu)域，lcnl40編碼的鋅指蛋白含有4個C3HI型鋅指結(jié)構(gòu)域和4個簡單重復(fù)序列。LCDVcn鋅指蛋白的研究將有助于進(jìn)一步了解LCDV的發(fā)生與發(fā)展，為闡明病毒致病的分子機理提供科學(xué)依據(jù)。迄今，病毒DNA疫苗在抗病毒性疾病上取得了很大成功，