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文檔簡(jiǎn)介
1、研究背景:
良性前列腺增生(benignprostatehyperplasia,BPH)是一種漸進(jìn)性的病理過(guò)程。在過(guò)去的50年里,有關(guān)BPH的病因已有大量的研究證實(shí),其中雄激素與其受體在前列腺增生的發(fā)生和發(fā)展中起著重要作用,但它不是導(dǎo)致BPH的決定原因,也沒(méi)有一種理論能夠確定其中的因果關(guān)系。盡管人們?cè)缇桶l(fā)現(xiàn)在增生的前列腺組織標(biāo)本中免疫細(xì)胞浸潤(rùn)與炎癥反應(yīng)的存在,但這一現(xiàn)象卻被大多數(shù)臨床與病理醫(yī)生所忽視,更低估了炎癥免疫過(guò)程在
2、BPH發(fā)生、發(fā)展中的關(guān)鍵作用。炎癥免疫過(guò)程在BPH病因和癥狀進(jìn)展中可能起著關(guān)鍵作用。病理組織學(xué)研究發(fā)現(xiàn):前列腺免疫學(xué)改變通常先于BPH的組織學(xué)改變。在BPH的發(fā)展中,免疫炎癥和間質(zhì)細(xì)胞互相作用與影響,使BPH長(zhǎng)期存在慢性炎癥免疫應(yīng)答過(guò)程。前列腺免疫學(xué)已發(fā)展成為BPH病因研究的一個(gè)新領(lǐng)域,人們開(kāi)始思考與研究炎癥免疫與前列腺增生、進(jìn)展是否存在因果關(guān)系,BPH組織中白細(xì)胞增多的原因與特征,在炎癥免疫與BPH反應(yīng)過(guò)程中,BPH組織細(xì)胞、免疫細(xì)胞
3、、促炎癥細(xì)胞因子三者之間在前列腺分子免疫網(wǎng)絡(luò)中的調(diào)節(jié)效應(yīng)與生物學(xué)功能,性激素與炎癥免疫在BPH發(fā)生、發(fā)展過(guò)程中的作用,已成為前列腺免疫學(xué)研究的熱點(diǎn)問(wèn)題。
組織學(xué)前列腺炎(histologicalprostatitis)的病因目前尚不是很清楚。其主要的局限在于組織標(biāo)本的獲取困難以及診斷標(biāo)準(zhǔn)的不統(tǒng)一,導(dǎo)致對(duì)其的研究一直未獲進(jìn)展,其對(duì)前列腺組織生理功能的影響以及與各類(lèi)前列腺臨床癥狀發(fā)生的相關(guān)性也缺乏進(jìn)一步的研究。因此有必要對(duì)組織
4、學(xué)前列腺炎的病因?qū)W以及其對(duì)前列腺癥狀的影響進(jìn)行深入的研究。目前對(duì)組織學(xué)前列腺炎標(biāo)本的獲取主要來(lái)自前列腺增生患者,因此對(duì)組織學(xué)前列腺炎的研究通常兼顧對(duì)前列腺增生的研究。
維生素D即1,25-(OH)2D3,在體內(nèi)必須通過(guò)維生素D受體(vitaminDreceptor,VDR)發(fā)生作用。VDR是親核蛋白,屬類(lèi)固醇激素/甲狀腺激素受體超家族成員,是介導(dǎo)1,25-(OH)2D3發(fā)揮生物學(xué)效應(yīng)的核內(nèi)大分子。VDR是核受體超家族的成員
5、之一,存在于靶細(xì)胞核內(nèi)。人類(lèi)VDR基因位于12q13-14上,全長(zhǎng)約78000bp,由11個(gè)外顯子和11個(gè)內(nèi)含子組成。VDR分為核受體(nVDR)和膜受體(mVDR)2類(lèi)。nVDR影響基因表達(dá),控制相應(yīng)蛋白質(zhì)的合成,mVDR則主要參與鈣磷平衡的維持。人體幾乎所有細(xì)胞均有VDR的存在。1,25-(OH)2D3在體內(nèi)具有多種生物學(xué)功能,如調(diào)控免疫應(yīng)答、控制細(xì)胞增殖和分化、體內(nèi)礦物質(zhì)平衡等,其功能主要是通過(guò)VDR介導(dǎo)的。VDR具有廣泛的生物學(xué)
6、效應(yīng),包括維持體內(nèi)血清鈣和磷的穩(wěn)定,調(diào)節(jié)細(xì)胞增殖、分化及免疫調(diào)節(jié)功能等。其與1,25-(OH)2D3結(jié)合,可改變VDR的轉(zhuǎn)錄效率。調(diào)節(jié)鈣磷代謝是VDR的主要功能。近年來(lái)發(fā)現(xiàn)其在對(duì)機(jī)體的免疫功能亦有重要的調(diào)節(jié)作用。VDR與多種疾病的發(fā)生有相關(guān)性,已成為近年來(lái)醫(yī)學(xué)研究的熱點(diǎn)。
單核苷酸多態(tài)性(singlenucleotidepolymorphism,SNP)是人類(lèi)基因組中最常見(jiàn)、分布最廣泛的DNA多態(tài)性類(lèi)型,大約每1000bp
7、就存在一個(gè)SNP。是人類(lèi)基因組中物理圖譜的理想遺傳標(biāo)記,能滿足對(duì)代謝、生長(zhǎng)和疾病相關(guān)基因的定位。被認(rèn)為是繼限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性和微衛(wèi)星多態(tài)性之后的第三代遺傳標(biāo)記。在人類(lèi)基因組中大約有300萬(wàn)個(gè)SNP。SNP在群體中的發(fā)生頻率不小于1%。SNP所表現(xiàn)的多態(tài)性只涉及到單個(gè)堿基的變異,這種變異可由單個(gè)堿基的轉(zhuǎn)換(transition),即一種嘌呤替換成另一種嘌呤,或一種嘧啶替換成另一種嘧啶;或顛換(transversion),即嘌呤與嘧啶之間
8、的互換所引起;也可由堿基的插入或缺失所致。轉(zhuǎn)換與顛換的比例為2:1。SNP有如下幾個(gè)特點(diǎn):(1)密度高。SNP是目前為止人類(lèi)基因組中分布最廣泛、數(shù)量最多的的DNA多態(tài)型,大約90%的人類(lèi)遺傳變異是SNP。而STR在整個(gè)基因組中約15kb才有一個(gè)STR位點(diǎn)。(2)片段短。SNP基因座的片段更短,更易進(jìn)行PCR擴(kuò)增,并且產(chǎn)物的長(zhǎng)度不到100bp,這與300~400bp的STRs相比能夠更好地適用于降解的DNA樣本。(3)遺傳穩(wěn)定性強(qiáng)。STR
9、在基因組中存在不穩(wěn)定和密度相對(duì)較低,SNP具有更高的遺傳穩(wěn)定性,可以用于群體遺傳學(xué)的研究。(4)易于高通量、自動(dòng)化分析。SNP大都表現(xiàn)為二等位基因標(biāo)記,在檢測(cè)時(shí)只需要通過(guò)簡(jiǎn)單的“+/-”或“有/無(wú)”來(lái)進(jìn)行基因分型,易于進(jìn)行分型和確定基因頻率,有利于各實(shí)驗(yàn)室基因判型的標(biāo)準(zhǔn)化和質(zhì)量控制,適于快速、高通量檢測(cè)和自動(dòng)化分析。SNP是目前人類(lèi)基因組的一個(gè)研究熱點(diǎn),在遺傳作圖、群體遺傳學(xué)、疾病預(yù)防診斷治療、癌癥等方面具有不可估量的影響。
10、 已有研究結(jié)果表明在不同人群中VDR基因上存在有SNP的差異。由于存在SNP種族的差異性,從而導(dǎo)致不同種族人群對(duì)某些疾病有遺傳易感染性。VDR基因啟動(dòng)子上存在FokⅠ位點(diǎn)F/f單核苷酸多態(tài)性,F(xiàn)okⅠ位點(diǎn)多態(tài)性造成了VDRmRNA轉(zhuǎn)錄和表達(dá)水平上的差異,進(jìn)而造成VDR活性不同,而VDR活性的改變會(huì)導(dǎo)致其許多生理功能發(fā)生變化。其中與組織學(xué)前列腺炎有關(guān)系的功能之一為免疫調(diào)節(jié)。目前已經(jīng)發(fā)現(xiàn)的VDR基因上存在的與疾病發(fā)生有關(guān)的基因多態(tài)性位點(diǎn)有
11、BsmⅠ、TaqⅠ、FokⅠ等酶切位點(diǎn),其中FokⅠ位于啟動(dòng)子上,啟動(dòng)子結(jié)構(gòu)的改變對(duì)因的表達(dá)會(huì)產(chǎn)生重要的調(diào)節(jié)作用。已有的研究發(fā)現(xiàn)VDR基因多態(tài)性與某些慢性炎癥性疾病的發(fā)生有一定關(guān)系。王振華等的研究發(fā)現(xiàn)VDR基因多態(tài)性分布差異與小兒反復(fù)呼吸道感染有一定的相關(guān)性。他們選取的是Bsm-Ⅰ多態(tài)性位點(diǎn),發(fā)現(xiàn)反復(fù)呼吸道感染的患兒B等位基因頻率有增高的趨勢(shì)。張立等對(duì)124例慢性牙周炎患者和91例健康對(duì)照者分析后發(fā)現(xiàn),VDR上的TaqⅠ位點(diǎn)多態(tài)性中,t
12、等位基因可提高中國(guó)漢族人群患早發(fā)性牙周炎的風(fēng)險(xiǎn)。李升等運(yùn)用Meta分析對(duì)TaqⅠ基因多態(tài)性與慢性牙周炎易感性進(jìn)行了研究,發(fā)現(xiàn)388名慢性牙周炎患者和355名對(duì)照者中TaqⅠ基因多態(tài)性與慢性牙周炎的易感性無(wú)關(guān)。因此,VDR基因多態(tài)性與非感染性炎癥性疾病的關(guān)系值得進(jìn)一步研究。
在分析和研究SNP的諸多方法中,通過(guò)聚合酶鏈反應(yīng)—限制性片斷長(zhǎng)度多態(tài)性方式(polymerasechinareaction-restrictionfra
13、gmentlengthpolymorphism,PCR-RFLP)為目前運(yùn)用較多且十分成熟的方法。其基本原理為:首先利用DNA提取技術(shù)分離和純化目的基因片段,然后運(yùn)用PCR技術(shù)對(duì)目的基因片段進(jìn)行特異性擴(kuò)增,再利用針對(duì)特殊酶切位點(diǎn)的生物酶進(jìn)行目的基因片段的酶切,最后對(duì)酶切后的片段進(jìn)行電泳,判讀其基因型。其中PCR技術(shù)經(jīng)過(guò)多年的發(fā)展,已經(jīng)成為研究基因組學(xué)相當(dāng)成熟的實(shí)驗(yàn)平臺(tái),用于擴(kuò)增目的基因。而RFLP技術(shù)也在不斷進(jìn)步和發(fā)展,為SNP相關(guān)研究
14、提供了有力的技術(shù)支持。
目的和意義:
1.本研究通過(guò)PCR-RFLP方法檢測(cè)前列腺增生合并組織學(xué)前列腺炎和單純良性前列腺增生患者VDR基因啟動(dòng)子上存在的FokⅠ位點(diǎn)SNP基因型,分析VDR基因啟動(dòng)子上存在的FokⅠ位點(diǎn)SNP不同的基因型與前列腺增生合并組織學(xué)前列腺炎發(fā)生之間的相關(guān)性。探討組織學(xué)前列腺炎的發(fā)生有無(wú)遺傳易感性,尋找組織學(xué)前列腺炎的遺傳性病因。
2.探討VDR基因啟動(dòng)子上存在的FokⅠ
15、位點(diǎn)SNP是否為組織學(xué)前列腺炎發(fā)生的風(fēng)險(xiǎn)因素之一,為指導(dǎo)組織學(xué)前列腺炎的一級(jí)預(yù)防提供依據(jù)。
3.通過(guò)分析VDR基因啟動(dòng)子上存在的FokⅠ位點(diǎn)SNP與組織學(xué)前列腺炎嚴(yán)重程度分型之間的關(guān)系,為指導(dǎo)組織學(xué)前列腺炎的病理診斷分型以及指導(dǎo)臨床治療提供一定的參考。
4.通過(guò)基因測(cè)序方法檢驗(yàn)PCR-RFLP方法分析SNP基因的準(zhǔn)確性和可重復(fù)性。為開(kāi)展SNP的分析提供實(shí)驗(yàn)指導(dǎo)。
方法:
收集200
16、8年8月至2011年11月在廣州市紅十字會(huì)醫(yī)院泌尿外科治療的前列腺增生合并組織學(xué)前列腺炎患者169例(炎癥組),術(shù)后組織病理檢查示前列腺增生,慢性前列腺炎,平均年齡73.9±2.7歲。同時(shí)收集156例單純前列腺增生患者(對(duì)照組),病理檢查示前列腺增生,平均年齡73.56±2.68歲。兩組患者標(biāo)本均為行經(jīng)尿道前列腺電切(TURP)術(shù)后獲得。取得標(biāo)本后,常規(guī)行10%的中性福爾馬林浸泡。行常規(guī)病理組織學(xué)檢查。并收集兩組患者相關(guān)基本臨床資料,P
17、SA,IPSS評(píng)分,前列腺體積,尿流率以及前列腺增生藥物治療情況等。
通過(guò)聚合酶鏈反應(yīng)-限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性(Polymerasechainreaction-restrictionfragmentlengthpolymorphism,PCR-RFLP)檢測(cè)研究對(duì)象VDR基因啟動(dòng)子上存在的FokⅠ位點(diǎn)SNP基因型:1.從NCBI的genebank中檢索VDR基因的相關(guān)資料,獲得其基因序列,2.采用Genefisher軟件設(shè)計(jì)
18、PCR引物,3.利用TIANampGenomicDNAKit試劑盒提取目的基因DNA片段,4.在PCR儀上進(jìn)行目的基因的擴(kuò)增,5.鑒定擴(kuò)增后的目的基因片段,6.對(duì)擴(kuò)增后目的基因片段進(jìn)行特異性酶切,7.收集酶切后的片段進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳,8.對(duì)電泳結(jié)果進(jìn)行判讀。9.通過(guò)基因測(cè)序方法對(duì)酶切結(jié)果進(jìn)行分析,評(píng)估PCR-RFLP的準(zhǔn)確性。
運(yùn)用常規(guī)病理方法檢查單純良性前列腺增生以及前列腺增生合并組織學(xué)前列腺炎的發(fā)生情況,并對(duì)組織學(xué)前
19、列腺炎的嚴(yán)重程度進(jìn)行分型,以此為依據(jù)進(jìn)行研究對(duì)象的分組。
統(tǒng)計(jì)學(xué)處理:
所有數(shù)據(jù)采用SPSS13.0統(tǒng)計(jì)軟件分析。良性前列腺增生合并組織學(xué)前列腺炎和單純前列腺增生患者的年齡,PSA,IPSS評(píng)分,前列腺體積,尿流率等相關(guān)臨床資料對(duì)比采用t檢驗(yàn)。根據(jù)Hardy-weinberg定律,采用直接計(jì)算法計(jì)算兩組基因型和等位基因頻率的實(shí)際數(shù)和預(yù)期數(shù),了解各基因型在人群中遺傳平衡的符合程度,采用x2檢驗(yàn)。比較兩組基因型以
20、及等位基因頻率的差異性,采用x2檢驗(yàn)。兩兩比較用分割的x2檢驗(yàn)。比較不同嚴(yán)重程度的組織學(xué)前列腺炎之間基因型以及等位基因頻率的差異性,采用x2檢驗(yàn)。采用多元Logistic回歸法分析VDR基因啟動(dòng)子上存在的FokⅠ位點(diǎn)SNP不同的基因型與BPH合并組織學(xué)前列腺炎發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)之間的關(guān)系。通過(guò)逐步回歸對(duì)控制年齡等因素后的風(fēng)險(xiǎn)進(jìn)行評(píng)估。P<0.05說(shuō)明差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,P<0.01說(shuō)明差異有顯著統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
研究?jī)?nèi)容和過(guò)程:
21、 1.本研究采用病例對(duì)照研究方法,制定良性前列腺增生合并組織學(xué)前列腺炎以及單純前列腺增生的納入以及排除標(biāo)準(zhǔn),選定研究對(duì)象,2.用TIANampGenomicDNAKit試劑盒(深圳晶美公司提供)提取169例前列腺增生合并組織學(xué)前列腺炎患者以及156例單純前列腺增生的目的基因片段,3.運(yùn)用PCR方法擴(kuò)增目的基因片段,4.通過(guò)RFLP方法分析研究對(duì)象VDR基因啟動(dòng)子FokⅠ位點(diǎn)SNP基因型,5.通過(guò)基因測(cè)序方法對(duì)酶切結(jié)果進(jìn)行分析,評(píng)估P
22、CR-RFLP實(shí)驗(yàn)的準(zhǔn)確性,6.運(yùn)用常規(guī)病理檢查方法確診單純良性前列腺增生以及前列腺增生合并組織學(xué)前列腺炎,同時(shí)對(duì)組織學(xué)前列腺炎的嚴(yán)重程度進(jìn)行分類(lèi),7.通過(guò)直接計(jì)算以及統(tǒng)計(jì)學(xué)方法進(jìn)行兩組研究對(duì)象的Hardy-weinberg平衡檢驗(yàn),分析觀察對(duì)象的群體代表性,8.通過(guò)統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件分析兩組觀察對(duì)象基本臨床資料差異性有無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,9.運(yùn)用統(tǒng)計(jì)學(xué)方法分析VDR基因啟動(dòng)子FokⅠ位點(diǎn)SNP與BPH合并組織學(xué)前列腺炎之間的相關(guān)性,并分析該SNP與
23、組織學(xué)前列腺炎嚴(yán)重程度之間的相關(guān)性,10.運(yùn)用單因素回歸分析法,分析VDR基因啟動(dòng)子上存在的FokⅠ位點(diǎn)SNP是否為組織學(xué)前列腺炎發(fā)生的風(fēng)險(xiǎn)因素。
結(jié)果:
1.對(duì)良性前列腺增生合并組織學(xué)前列腺炎以及單純前列腺增生患者VDR基因FokⅠ位點(diǎn)SNP基因型分布的實(shí)際數(shù)和預(yù)期數(shù)進(jìn)行直接計(jì)算,再通過(guò)x2檢驗(yàn),結(jié)果顯示實(shí)際數(shù)與預(yù)期數(shù)差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),符合Hardy-Weinberg定律,在遺傳學(xué)上說(shuō)明該人
24、群資料具有代表性。
2.對(duì)兩組患者的相關(guān)臨床資料進(jìn)行比較用t檢驗(yàn)。結(jié)果顯示兩組患者平均年齡無(wú)顯著差異(P=0.118),炎癥組PSA水平(ng/ml)顯著高于對(duì)照組(P=0.001);兩組患者術(shù)前血常規(guī)以及尿常規(guī)檢查未見(jiàn)感染,肝,腎功能檢查未見(jiàn)異常。國(guó)際前列腺癥狀(I-PSS)評(píng)分:炎癥組為15.4±2.5分,對(duì)照組為15.3±2.32分,兩組之間的差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.744)。兩組患者術(shù)前行經(jīng)腹部B超測(cè)量前列腺體積
25、,用左右、前后、上下三組徑線(毫米,mm)表示,炎癥組前列腺體積(毫升,ml)=0.52×(前列腺三徑的乘積)顯著大于對(duì)照組(P=0.027),術(shù)后前列腺切除重量(克,g)無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.423)炎癥組有35例術(shù)前無(wú)急性尿潴留,常規(guī)行尿流率檢查,對(duì)照組有40例行尿流率(ml/s)檢查,兩組其余患者均已停留尿管,兩組間已行的尿流率的差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.626)。
3.對(duì)兩組患者VDR基因啟動(dòng)子FokⅠ位點(diǎn)SNP基
26、因型進(jìn)行比較,采用x2檢驗(yàn)。結(jié)果顯示ff基因型在炎癥組為37%(62/169),對(duì)照組為25%(39/156),該基因型在兩組間的分布差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),而FF和Ff基因型在兩組之間的分布為:炎癥組:25%(43/169);對(duì)照組:35%(55/156)和38%(64/169);40%(62/156),差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著性意義(P>0.05)。F基因頻率在炎癥組為44%(150/338),對(duì)照組為55%(172/312),f
27、基因頻率在炎癥組為56%(188/338),對(duì)照組為:45%(140/312),兩組之間的差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。
4.本研究所選人群中重度組織學(xué)前列腺炎三種基因型的分布不符合Hardy-Weinberg定律,故該類(lèi)型在本研究中不具有人群代表性。而輕度以及中度組織學(xué)前列腺炎三種基因型的分布符合Hardy-Weinberg定律。故分析三種基因型在輕度和中度組織學(xué)前列腺炎之間的差異性。結(jié)果顯示FF、Ff以及ff基因型
28、在輕度炎癥組與中度炎癥之間的分布為:32%(25/79),23%(12/52);46%(36/79),40%(21/52);22%(18/79),37%(19/52),差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著性意義(P>0.05)。F基因頻率在輕度炎癥組和中度炎癥組分別為54%(86/158),43%(45/104),f基因頻率在兩組的分別為46%(72/158),57%(59/104),兩組之間的差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。
5.通過(guò)基因
29、測(cè)序方法對(duì)PCR-RFLP的實(shí)驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行分析,隨機(jī)抽取三種基因型各10例進(jìn)行基因測(cè)序,發(fā)現(xiàn)基因型符合實(shí)驗(yàn)前的基因排列。驗(yàn)證了PCR-RFLP實(shí)驗(yàn)的準(zhǔn)確性和可重復(fù)性。
6.以VDR基因啟動(dòng)子FokⅠ位點(diǎn)F/f單核苷酸多態(tài)性的基因型為自變量,以BPH合并組織學(xué)前列腺炎作為因變量,進(jìn)行BPH合并組織學(xué)前列腺炎危險(xiǎn)因素Logistic回歸分析。結(jié)果顯示,在控制了年齡等因素后,F(xiàn)okⅠ多態(tài)性是前列腺增生合并組織學(xué)前列腺炎發(fā)生的風(fēng)險(xiǎn)因
30、素(P<0.05)。其中ff基因型相對(duì)于FF基因型的OR值為2.03(0.279~0.866)其中Ff基因型相對(duì)于FF基因型的OR值為1.32(0.446~1.287),其中ff基因型相對(duì)于Ff基因型的OR值為1.54(0.382~1.105)。
結(jié)論
1.VDR基因啟動(dòng)子FokⅠ位點(diǎn)SNP中ff基因型以及f基因等位頻率在前列腺增生合并組織學(xué)前列腺炎和單純前列腺增生患者中的分布差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,說(shuō)明ff基因型
31、與組織學(xué)前列腺炎的發(fā)生有相關(guān)性。VDR基因啟動(dòng)子FokⅠ位點(diǎn)SNP作為一種遺傳標(biāo)記,說(shuō)明組織學(xué)前列腺炎的發(fā)生有人群遺傳易感性。從而為組織學(xué)前列腺炎的病理分型以及臨床治療提供一定的指導(dǎo)。
2.通過(guò)單因素Logistic回歸分析VDR基因啟動(dòng)子FokⅠ位點(diǎn)SNP與前列腺增生合并組織學(xué)前列腺炎發(fā)生之間的關(guān)系,發(fā)現(xiàn)VDR基因啟動(dòng)子FokⅠ位點(diǎn)SNP是組織學(xué)前列腺炎發(fā)生的獨(dú)立危險(xiǎn)因素。為從基因水平治療組織學(xué)前列腺炎提供參考。
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