TLR2和TLR4基因多態(tài)性與中國漢族人群真菌性角膜炎的相關性研究.pdf

1、T L R 2 和T L R 4 基因多態(tài)性與中國漢族人群真菌性角膜炎的相關性研究摘要目的探討T L R 2 和T L R 4 基因多態(tài)性與中國漢族人群真菌性角膜炎是否相關。方法選取2 0 1 0 年1 月至2 0 1 2 年1 1 月就診于我院的真菌性角膜炎患者1 0 9例( 病例組) 和1 6 0 例健康人( 對照組) ，分別選擇T L R 2 基因的r s 3 8 4 0 0 9 7 、r s 3 8 0 4 0 9 9 、r s

2、 2 0 8 3 2 8 7 、r s l 8 9 8 8 3 0 及T L R 4 基因的T S 4 5 4 7 8 7 9 3 、E S l 0 9 8 3 7 5 5和r s l 9 2 7 9 1 4 七個多態(tài)性位點，采用P C R 產物直接測序法對這七個位點進行基因分型，檢測其基因型及等位基因頻率，比較不同基因型在病例組和正常對照組的分布差異，分析中國漢族人群真菌性角膜炎與T L R 2 、T L R 4 基因的多態(tài)性是否相關

3、。結果在中國漢族人群T L R 4 基因中，病例組r s l 0 9 8 3 7 5 5位點突變型等位基因( A 等位基因) 頻率明顯高于對照組( 3 2 ．1 1 ％：2 2 ．1 9 ％，P - - O ．0 1 ) ，^ 等位基因構成的A A + A G 基因型在病例組中頻率明顯高于對照組( 5 4 ．1 3 ％：3 6 ．2 5 ％，P = O ．0 0 4 ) ，且使真菌性角膜炎的發(fā)病風險增加2 ．0 7 5 倍( O R =

4、 2 ．0 7 5 ，9 5 ％C I = 1 ．2 6 4 —3 ．4 0 7 ) 。單倍型分析顯示，包含r s l 0 9 8 3 7 5 5 突變型A 等位基因的單體型在病例組中頻率明顯高于對照組，與真菌性角膜炎的發(fā)病密切相關( 3 2 ．1 ％：2 0 ．9 ％，P = O ．0 0 3 ) 。T L R 2 基因各位點基因型及等位基因頻率在病例組及對照組中無明顯差異( P > 0 ．0 5 ) 。結論T L R 4 基因

5、的r s l 0 9 8 3 7 5 5 位點多態(tài)性與中國漢族人群真菌性角膜炎的發(fā)病密切相關，而T L R 2 基因的各位點多態(tài)性與中國漢族人群真菌性角膜炎的發(fā)病無明顯相關性。碩士研究生 王楠( 眼科學)指導教師 趙桂秋教授關鍵詞：T L R 2 ；T L R 4 ；真菌性角膜炎；基因多態(tài)性目錄引言???????????????????????????????????????????1第l 章材料與方法?????????????????

6、??????????- 31 ．1 實驗材料??????????????????????????????·31 ．1 ．1 實驗對象?????????????????????????????31 ．1 ．2 實驗主要儀器與設備????????????????????????31 ．1 ．3 實驗主要試劑及耗材????????????????????????41 ．2 實驗方法??????????????????????????

7、????41 ．2 ．1 外周血基因組D N A 的提取??????????????????????41 ．2 ．2 T o t a l D N A 含量及純度測定?????????????????????- 51 ．2 ．3 聚合酶鏈式反應( P C R ) ??????????????????????”51 ．2 ．4 瓊脂糖凝膠電泳??????????????????????????·61 ．2 ．5 目的片段D N A

8、 測序?????????????????????????·71 ．2 ．6 序列的比對分析??????????????????????????71 ．2 ．7 統(tǒng)計學分析????????????????????????????7第2 章結果??????????????????????????????·82 ．1 S N P 位點H a r d y —w e n b e r g 平衡檢驗及連鎖分析???????????

9、???·82 ．2 真菌性角膜炎病例組和對照組等位基因及基因型頻率???????????·82 ．3 真菌性角膜炎患者輕度、中度、重度組等位基因及基因型頻率???????1 02 ，4 真菌性角膜炎病例組組和對照組單倍型分析???????????????1 2第3 章討論??????????????????????????????1 3結論???????????????????????????????????????

10、?????··1 6參考文獻???????????????????????????????·1 7綜述????????????????????????????????????2 0綜述的參考文獻????????????????????????????- 2 8攻讀學位期問的研究成果????????????????????????3 3附圖?????????????????????????????????．．