基于線粒體基因組變異的越南和中國豬種的遺傳多樣性分析.pdf

1、越南是東南亞地區(qū)一個具有豐富遺傳多樣性的國家。近些年來，雖然在動物遺傳學(xué)上已經(jīng)開展了很多研究，但是仍然需要深入地進(jìn)行地方豬品種遺傳多樣性的分析。到目前為止，基于完整的線粒體基因組對越南地方豬種的遺傳變異研究很少。因此，本研究的目的是分析越南MongCai豬、Ban豬和野豬的遺傳多樣性。在越南Son La省，共采集了三個品種/豬種的耳組織樣品，在樣本采集的同時也對MongCai豬和Ban豬的表型進(jìn)行了記錄。通過提取樣品中的總DNA得到這些

2、豬種的整個線粒體基因組序列，然后與中國地方豬種進(jìn)行比較，采用Neighbor-Joining和UPGMA方法，構(gòu)建了7個越南和145個（從Genbank數(shù)據(jù)庫下載）來自中國、臺灣，韓國，日本和歐洲的豬完整線粒體基因組的系統(tǒng)發(fā)育樹。本研究結(jié)果如下:
　　1.對越南兩個地方品種豬進(jìn)行了系統(tǒng)調(diào)查，包括75頭MongCai豬和40頭Ban豬，收集了毛色，繁殖性狀數(shù)據(jù)，采集了耳組織樣品，另外還采集了2頭野豬的組織樣品。
　　2.Mon

3、g Cai豬的繁殖性能高于Ban豬。Mong Cai豬的總?cè)轭^數(shù)平均為13.47個，而Ban豬只有11.35個。Mong Cai和Ban豬的窩產(chǎn)仔數(shù)分別為11.8頭和7.66頭，平均出生個體重分別為0.54kg和0.44kg，斷奶仔豬重分別為5.57kg和4.46kg。
　　3.Mong Cai豬、Ban豬和野豬的整個線粒體基因組均含有37個編碼基因，其中包括2個核糖體RNA,13個蛋白質(zhì)編碼基因，22個轉(zhuǎn)運RNA基因和1個控制區(qū)

4、。每個個體的整個線粒體基因組的總長度具有差異，約16.5～16.7kb，含有34％的堿基A，25％的堿基T，26％的堿基C和13％的堿基G，A和T較為豐富（約占60％）。
　　4.系統(tǒng)發(fā)育樹表明越南豬和中國豬的親緣關(guān)系比較近，特別是Mong Cai豬和巴馬香豬具有很近的遺傳關(guān)系，Ban豬和Banna微型豬以及滇南小耳豬較近。有趣的是，越南野豬和很多中國豬品種具有共同的祖先。中越兩國之間較近的地理位置和人及動物的頻繁交流可能是這些豬