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文檔簡介
1、1、山羊中FSHβ基因遺傳標記的強近代正選擇
促卵泡激素(FSH)是糖蛋白類激素,由腦下垂體前葉腺的促性腺細胞分泌。它調(diào)控性腺的發(fā)育及功能,并且對哺乳動物的生殖功能十分重要?;蜻x擇模式的檢測的是了解多位點遺傳最重要的部分之一。這項研究使用的是基于FST技術(shù)的方法,在中國四個山羊品種的單核苷酸多態(tài)性(SNPs)上進行離群位點檢測。使用SNPs的離群位點檢測方法表明FSHβ受到自然選擇。另外10個物種的核苷酸序列也被用來檢測FS
2、Hβ基因的選擇作用,結(jié)果表明,該基因之前受到純化選擇,但目前正受到正選擇作用。山羊和其它物種的FSHβ基因的核苷酸序列分析顯示其編碼序列相似(綿羊:55%,馬:55%,牛:54%,兔:49%,人48%)。在這項研究中確認的離群基因位點可有助于闡明,由于本地的氣候變化和頻繁的群體間交流引起的適應(yīng)性變異揭示了它們適應(yīng)新環(huán)境的能力??偠灾?,曾經(jīng)受到純化選擇的FSHβ基因目前正受到顯著的正選擇。
2、FSHR基因多態(tài)性與選擇信號的鑒
3、定及其對湖羊產(chǎn)羔數(shù)的影響
本文研究了湖羊群體中FSHR基因的遺傳變異,并探究其在湖羊群體中受選擇情況。本研究利用基因測序技術(shù)查找綿羊FSHR基因中的SNP位點,利用基于FST的差異去探測綿羊FSHR基因受選擇信號,結(jié)果表明第九外顯子上的C198T的FST值高于期望值,其可能受到人工選擇。為了研究FSHR基因物種間的進化情況,利用數(shù)據(jù)庫中17個物種的序列,用最大似然模型檢測選擇信號,結(jié)果顯示FSHR基因在物種間沒有檢測到正選擇信
4、號,但發(fā)現(xiàn)了19S,329L,349Pand369 R受正選擇位點。對綿羊FSHR基因的蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測發(fā)現(xiàn)C198T位于與GnRH通路互作的蛋白保守區(qū)域,故可能改變FSHR基因的功能。通過測序共鑒定了15個SNP,其中12個位于內(nèi)含子區(qū)域,三個位于外顯子區(qū)域。2個內(nèi)含子SNP(G247T,A249G)及外顯子9上的一個SNP(C198T)與湖羊第二胎產(chǎn)羔數(shù)相關(guān),基因型頻率分別是GT(0.18)、GG(0.72)、TT(0.1),AG(0.
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