遺傳變異與結(jié)直腸癌和非霍奇金淋巴瘤易感性及直腸癌術(shù)后同步放化療副反應(yīng)的研究.pdf

1、我國結(jié)直腸癌(colorectal cancer，CRC)和非霍奇金淋巴瘤(non-Hodgkinlymphoma，NHL)的發(fā)病率均呈現(xiàn)上升趨勢。單核苷酸多態(tài)(single nucleotidepolymorphism, SNP)是最主要的遺傳變異形式，是個(gè)體之間腫瘤易感性及治療與藥物反應(yīng)性等生物學(xué)性狀差異的重要遺傳學(xué)基礎(chǔ)。本研究旨在探討與CRC和NHL易感性以及直腸癌治療毒副反應(yīng)相關(guān)的遺傳因素。
　　 位于基因3'非翻譯區(qū)的

2、SNP可能通過影響基因轉(zhuǎn)錄本與microRNA的結(jié)合能力，而影響目的基因的表達(dá)和個(gè)體的腫瘤易感性?；谶@一研究假設(shè)，我們首先通過數(shù)據(jù)庫尋找CRC組織中差異表達(dá)基因，并搜尋基因3'非翻譯區(qū)位于microRNA結(jié)合位點(diǎn)的具有潛在生物學(xué)功能的SNP，在2003例CRC患者和2016例正常對(duì)照中進(jìn)行病例-對(duì)照研究。基因分型采用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)-限制性片段長度多態(tài)性(polymerase chain reaction-based restricti

3、on fragment length polymorphism,PCR-RFLP)技術(shù)。SNP與CRC易感性的關(guān)聯(lián)以logistic回歸模型計(jì)算各基因型的比值比(odds ratio，OR)及其95％可信區(qū)間(confidence interval，CI)表示。采用雙熒光素酶報(bào)告基因?qū)嶒?yàn)和實(shí)時(shí)定量PCR實(shí)驗(yàn)進(jìn)行遺傳變異的生物學(xué)功能研究。生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn)5個(gè)可能影響microRNA與基因轉(zhuǎn)錄本結(jié)合的SNP即KRASrs1137188、K

4、RAS rs7973450、KRAS rs9266、KRAS rs712和TLR4 rs7873784。關(guān)聯(lián)研究結(jié)果顯示TLR4 rs7873784與CRC的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)顯著相關(guān)，C等位基因(CC或GC基因型)攜帶者發(fā)生CRC的風(fēng)險(xiǎn)比GG基因型攜帶者降低30％(OR=0.70，95％CI=0.59-0.84;P=1.35×10-4)。功能實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示TLR4是hsa-let-7d-3p和hsa-let-7e-3p的靶基因，rs7873784

5、 G＞C遺傳變異影響hsa-let-7d-3p和hsa-let-7e-3p對(duì)TLR4基因的表達(dá)調(diào)控。分子流行病學(xué)和功能研究相一致的結(jié)果強(qiáng)烈支持TLR4rs7873784 G＞C變異影響結(jié)直腸癌遺傳易感性。
　　 Ⅱ/Ⅲ期直腸癌術(shù)后同步放化療可提高患者的局部控制率和長期生存率，是標(biāo)準(zhǔn)的輔助治療手段。在腫瘤治療過程中，接受同樣治療方案的患者，急性毒副反應(yīng)的發(fā)生具有個(gè)體差異?；颊哌z傳差異是導(dǎo)致毒副反應(yīng)個(gè)體差異的重要原因。我們通過候選基

6、因的方法選擇卡培他濱藥物代謝通路和DNA損傷應(yīng)答通路中的12個(gè)重要基因，篩選出位于這些基因功能區(qū)域的45個(gè)標(biāo)簽SNP，探討這些遺傳變異與直腸癌術(shù)后同步放化療急性毒副反應(yīng)的關(guān)系。研究對(duì)象是477例參加Ⅱ/Ⅲ期直腸癌根治術(shù)后卡培他濱為主同步放化療前瞻性Ⅲ期臨床隨機(jī)分組研究的患者。毒副反應(yīng)根據(jù)不良反應(yīng)常用術(shù)語標(biāo)準(zhǔn)3.0版進(jìn)行評(píng)價(jià)?；蚍中筒捎肧equenom MassARRAY系統(tǒng)進(jìn)行。SNP與急性毒副反應(yīng)的關(guān)聯(lián)以logistic回歸模型計(jì)算

7、各基因型的OR及其95％ CI表示。經(jīng)FDR多重校正后，結(jié)果顯示3個(gè)遺傳變異即TP rs11479、ATMrs189037和ATM rs227092與患者發(fā)生中重度白細(xì)胞減少的風(fēng)險(xiǎn)降低相關(guān)，加性模型的OR值分別為0.56(95％ CI=0.38-0.81;P=0.003，rs11479)，0.62(95％ CI=0.46-0.85;P=0.003, rs189037)和0.57(95％ CI=0.42-0.78;P＜0.001, rs2

8、27092)。而且，TP rs11479與中重度白細(xì)胞減少的發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)只在單藥治療組中顯著相關(guān)。
　　 在中國人群和高加索人群中，NHL的發(fā)病率和亞型分布差異顯著。我們探討了NHL全基因組關(guān)聯(lián)研究發(fā)現(xiàn)的相關(guān)SNP與中國人群NHL的易感性。根據(jù)文獻(xiàn)檢索，全基因組關(guān)聯(lián)研究共發(fā)現(xiàn)15個(gè)SNP與NHL的亞型淋巴瘤易感性相關(guān)。我們在中國漢族人群的792例NHL患者和1542例正常對(duì)照中進(jìn)行病例-對(duì)照研究?；蚍中筒捎肞CR-RFLP方法。S

9、NP與NHL易感性的關(guān)聯(lián)以logistic回歸模型計(jì)算各基因型的OR及其95％ CI表示。結(jié)果顯示15個(gè)SNP的等位基因頻率在中國漢族人群和高加索人群中具有明顯差異，3個(gè)遺傳變異（rs13397985、rs735665和rs11083846）在中國漢族人群中極其罕見。關(guān)聯(lián)研究結(jié)果顯示2個(gè)遺傳變異IRF4 rs872071和HLA-DQB1 rs2647012與中國漢族人群NHL的易感性相關(guān)，加性模型的OR值分別為1.20(95％ CI=

10、1.05-1.38; P=0.009,rs872071)和1.20(95％ CI,1.03-1.39; P=0.018,rs2647012)。
　　 本研究發(fā)現(xiàn)TLR4 rs7873784遺傳變異影響microRNA對(duì)基因的表達(dá)調(diào)控，并且影響CRC的易感性。位于TP和ATM基因的遺傳變異影響直腸癌患者接受卡培他濱為主同步放化療過程中出現(xiàn)的白細(xì)胞減少毒副反應(yīng)。NHL易感性的研究顯示，IRF4 rs872071和HLA-DQB1 r