膀胱癌遺傳分數(shù)的計算及發(fā)病風險預測模型的構建.pdf

1、背景：膀胱癌是泌尿系統(tǒng)常見腫瘤之一。在中國，隨著生活習慣的改變及診療水平的提高，膀胱癌的發(fā)病率逐年增長。2012年全國腫瘤登記地區(qū)膀胱癌的發(fā)病率為6.61/10萬，已經(jīng)成為主要的公共衛(wèi)生問題。膀胱癌的發(fā)病不僅給患者帶來了嚴重的痛苦，而且給社會和家庭也帶來了一定的經(jīng)濟負擔。近年來，歐美國家在膀胱癌的遺傳易感性研究上取得了極大進展，截止目前，通過全基因組關聯(lián)分析(Genome Wide Association Studies，GWAS)的方

2、法共發(fā)現(xiàn)13個與膀胱癌發(fā)病風險有關的單核苷酸多態(tài)性位點(Single nucleotide polymorphism，SNPs)。其中有3個SNP在中國人群中得到了驗證。但是，這3個SNP位點在中國人群中的聯(lián)合作用還未可知。
　　方法：基于已發(fā)現(xiàn)并在中國人群中驗證的3個與膀胱癌發(fā)病風險的SNP位點，在來自中國上海的1210名膀胱癌患者及1008名社區(qū)對照中選用TaqMan探針進行基因分型實驗，并通過計算研究對象基于這3個SNPs位

3、點的遺傳分數(shù)(geneticscore)對這些遺傳變異的綜合預測膀胱癌發(fā)病風險效應進行了分析。接下來聯(lián)合研究對象的吸煙狀況（有或無），身體質(zhì)量指數(shù)(Body Mass Index, BMI)，對男性人群經(jīng)過年齡的校正建立膀胱癌發(fā)病風險的預測模型，模型的區(qū)分能力和模型的準確度使用受試者工作曲線(receiver operating characteristic curve，ROC)和Hosmer-Lemeshow goodness-of-

4、fit檢驗并進行評價。
　　結果：
　　1.在我們獨立的驗證人群中，3個SNPs位點均與膀胱癌發(fā)病風險相關(P＜0.05)。
　　2.基于3個SNPs位點計算得到的遺傳分數(shù)在病例組明顯高于對照組，其均值分別為1.05和0.99(P=1.03E-05)。經(jīng)過年齡，性別和吸煙狀態(tài)的校正，與遺傳分數(shù)＜=1.00者相比，擁有較高genetic score值(＞1.00)會使其膀胱癌發(fā)病風險增加（OR=1.58，95％ CI=1

5、.21-2.06，P=0.0007）。
　　3.低級別腫瘤(Ta)與膀胱癌的發(fā)病風險(OR=2.24，95％ CI=1.66-3.01，P=1.02E-07)較高級別腫瘤(Tis，T1-T4)更為明顯(OR=1.33，95％CI=1.00-1.78,P=0.05, P=0.001)。
　　4.基于所有男性樣本，建立的膀胱癌發(fā)病預測模型為E{Yi}=ln(πi/1-πi)=0.40 Xsmoking+0.45 Xgenetic