不同水陸生境中喜旱蓮子草表觀遺傳調(diào)控因子動態(tài)表達(dá)式樣分析.pdf

1、喜旱蓮子草(Alternanthera philoxeroides(Mart.) Griseb.）是一種入侵植物，種內(nèi)遺傳多樣性很低，主要依靠極強(qiáng)的表型可塑性入侵不同生境。表型可塑性變異與基因選擇性表達(dá)密切相關(guān)，而表觀遺傳調(diào)控因子（如:DNA甲基化）參與基因的表達(dá)調(diào)控，介導(dǎo)可塑性變異的發(fā)生。為了解喜旱蓮子草適應(yīng)不同水陸生境過程中表觀遺傳調(diào)控因子的作用，我們對同質(zhì)園中栽培的喜旱蓮子草進(jìn)行不同水陸條件處理，并運(yùn)用實(shí)時熒光定量PCR、亞硫酸氫

2、鈉測序、RNA-Seq高通量測序等方法檢測各類表觀遺傳調(diào)控因子在不同環(huán)境條件下動態(tài)表達(dá)的特點(diǎn)，為研究喜旱蓮子草表型可塑性變異發(fā)生的分子基礎(chǔ)提供依據(jù)。研究結(jié)果顯示:
　　(1)16個表觀遺傳調(diào)控相關(guān)基因在不同水陸處理?xiàng)l件下、在不同處理時間點(diǎn)表達(dá)水平變化顯著，且多在水淹處理早期被強(qiáng)烈誘導(dǎo)上調(diào)。
　　(2)兩個在不同水陸處理下顯著差異表達(dá)基因的啟動子區(qū)中多個胞嘧啶位點(diǎn)甲基化修飾式樣隨不同處理?xiàng)l件以及不同處理時間呈現(xiàn)動態(tài)變化的特點(diǎn)，

3、其中涉及一些保守調(diào)控元件和部分連續(xù)分布的非對稱胞嘧啶位點(diǎn)。
　　(3)對不同水陸處理?xiàng)l件下miRNA表達(dá)譜進(jìn)行分析，發(fā)現(xiàn)118個與不同處理?xiàng)l件相關(guān)且在不同處理時間點(diǎn)差異表達(dá)的miRNA，根據(jù)表達(dá)式樣將這些miRNA分為12類。
　　本研究結(jié)果初步揭示了喜旱蓮子草響應(yīng)不同水陸生境過程中表觀遺傳調(diào)控因子的動態(tài)表達(dá)式樣，證實(shí)了表觀遺傳變異與喜旱蓮子草表型可塑性變異的相關(guān)性，為深入研究喜旱蓮子草通過表型可塑性變異廣泛適應(yīng)不同水陸生境