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1、針對(duì)PBmice小鼠信息系統(tǒng)功能擴(kuò)展的需求,文章提出并實(shí)現(xiàn)了PBMICE-SR語(yǔ)義檢索框架。檢索框架在PBmice系統(tǒng)基礎(chǔ)上提供了智能獲取數(shù)據(jù)的方法,提高了試驗(yàn)研究中數(shù)據(jù)獲取的效率,避免了人為的操作失誤,使原本需要大量專業(yè)人員進(jìn)行的信息篩選和知識(shí)推理工作可以采用機(jī)器自動(dòng)完成。
文章主要闡述了PBMICE-SR框架在J2EE-SSH架構(gòu)下,框架核心技術(shù)的研究,核心模塊具體的設(shè)計(jì)與實(shí)現(xiàn),和框架整體的測(cè)試分析??蚣芫唧w實(shí)施分為三
2、個(gè)階段,其研究方法和研究成果具體如下:
一、檢索數(shù)據(jù)準(zhǔn)備階段,其核心模塊包括生物元數(shù)據(jù)自動(dòng)抽取和抽取數(shù)據(jù)的RDF統(tǒng)一標(biāo)記。文章在多分類支持向量機(jī)基礎(chǔ)上結(jié)合特征詞頻計(jì)算模型,設(shè)計(jì)了生物元數(shù)據(jù)自動(dòng)抽取模型DAGSVM-BM25,并利用Weka平臺(tái)整合SSH框架對(duì)模型進(jìn)行測(cè)試和實(shí)現(xiàn),結(jié)果顯示抽取模型的平均召回率和平均查準(zhǔn)率都在96%之上。
一、檢索數(shù)據(jù)載入階段,其核心功能是將準(zhǔn)備好的數(shù)據(jù)載入系統(tǒng)框架。針對(duì)生物數(shù)據(jù)量
3、大且復(fù)雜的特點(diǎn),文章基于面向切面理論,提出了系統(tǒng)邊緣邏輯分離機(jī)制,設(shè)計(jì)并實(shí)現(xiàn)了抽取數(shù)據(jù)載入切面。從系統(tǒng)加載時(shí)間和運(yùn)行時(shí)占用資源角度來(lái)看,采用邏輯分離機(jī)制后,系統(tǒng)的載入時(shí)間縮減58.9%,系統(tǒng)運(yùn)行時(shí)資源占用率降低約20%。
三、檢索執(zhí)行階段,這一階段主要設(shè)計(jì)檢索模型對(duì)載入的數(shù)據(jù)實(shí)例進(jìn)行語(yǔ)義檢索。文章基于SPARQL和OWL技術(shù)理論,設(shè)計(jì)了PBMICE-SR語(yǔ)義檢索模型,并利用Jena框架整合SSH框架進(jìn)行實(shí)現(xiàn),檢索示例表明語(yǔ)
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