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1、論文首先討論了最早提出的,也是最基本的生物序列相似性比較算法--兩序列全局相似性比較動(dòng)態(tài)規(guī)劃算法;然后,通過(guò)對(duì)生物序列的演化模型進(jìn)行討論,推導(dǎo)出生物序列演化關(guān)系計(jì)算和序列相似性比較計(jì)算的一致性;最后我們根據(jù)三條線索敘述序列相似性比較算法領(lǐng)域從七十年代到現(xiàn)在的發(fā)展過(guò)程以及最新的研究成果.接著論文討論了動(dòng)態(tài)規(guī)劃序列相似性比較算法的各種優(yōu)化研究.論文具體討論了序列重排和倒置問(wèn)題,提出了一種序列相似性比較的新算法,該算法克服了動(dòng)態(tài)規(guī)劃算法的非交
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