BioLab面向生物計(jì)算服務(wù)的網(wǎng)格系統(tǒng).pdf

1、生物信息學(xué)已成為能夠改變科學(xué)發(fā)展的決定性力量之一，網(wǎng)格計(jì)算為生物信息應(yīng)用提供了強(qiáng)大的計(jì)算和存儲(chǔ)平臺(tái)。然而，網(wǎng)格應(yīng)用首先需要解決服務(wù)集成、資源異構(gòu)、作業(yè)管理和調(diào)度等問題，同時(shí)向生物學(xué)家屏蔽上述復(fù)雜的底層實(shí)現(xiàn)。一個(gè)可行的方法是建立一個(gè)Web門戶作為中間媒介。
　　本文介紹了一個(gè)在網(wǎng)格環(huán)境下的生物門戶站點(diǎn)BioLab項(xiàng)目，系統(tǒng)定義了服務(wù)的提供者、部署者和使用者三種用戶角色；設(shè)計(jì)了網(wǎng)格環(huán)境下的服務(wù)和資源整合機(jī)制，實(shí)現(xiàn)了用戶管理以及作業(yè)調(diào)度

2、控制等功能；同時(shí)，系統(tǒng)提供了標(biāo)準(zhǔn)Web Service的接口，增加擴(kuò)展性。
　　我們分析了啟發(fā)式調(diào)度算法，選擇在線調(diào)度而非批處理調(diào)度以提高系統(tǒng)響應(yīng)速度。實(shí)驗(yàn)表明，在較大的作業(yè)平均到達(dá)時(shí)間條件下，非阻塞的調(diào)度方式的作業(yè)總完成時(shí)間比阻塞的調(diào)度方式??；當(dāng)作業(yè)平均到達(dá)時(shí)間增加時(shí)，作業(yè)總運(yùn)行時(shí)間也會(huì)增加，但速度會(huì)變緩；在較小的作業(yè)平均到達(dá)時(shí)間條件下，各種在線調(diào)度啟發(fā)式算法差別不大，而在較大的作業(yè)平均到達(dá)時(shí)間條件下，隨機(jī)性好的隨機(jī)調(diào)度算法和最