竹筍細(xì)胞壁木質(zhì)化及轉(zhuǎn)錄組差異基因表達(dá)分析與功能初探.pdf

1、竹筍即竹子膨大的芽和幼嫩的莖，具有高纖低脂，營(yíng)養(yǎng)齊全的特點(diǎn)，備受消費(fèi)者青睞。但竹筍采收后很快出現(xiàn)木質(zhì)化，喪失鮮嫩可口的食用品質(zhì)，成為竹筍產(chǎn)業(yè)發(fā)展的重要限制因素。因此，探究竹筍木質(zhì)化的發(fā)生及其分子機(jī)理為進(jìn)一步研究延長(zhǎng)竹筍貯運(yùn)期、降低采后損耗的新技術(shù)提供了理論支撐。本論文以毛竹筍上、中、下3個(gè)部位為試驗(yàn)材料，研究了毛竹筍不同部位細(xì)胞壁的成分變化以及與木質(zhì)化有關(guān)的轉(zhuǎn)錄組差異基因的表達(dá)情況，并初步分析了半纖維素木聚糖合成的關(guān)鍵基因PeIRX10

2、在竹筍組織次生細(xì)胞壁形成中的功能。得到如下結(jié)論:
　　(1)毛竹筍不同部位因木質(zhì)化程度不同，細(xì)胞壁中各組分的含量不同。沿著竹筍的生長(zhǎng)方向，木質(zhì)素和纖維素含量由上部到下部逐漸增加，而果膠和半纖維素的含量逐漸降低，同時(shí)木質(zhì)素合成相關(guān)酶PAL、CAD和C4H的活性也由上部到下部逐漸增加，說(shuō)明毛竹筍在下部的木質(zhì)化程度高于上部和中部。
　　(2)對(duì)毛竹筍的上、中、下三個(gè)部分分別進(jìn)行RNA-seq分析，共獲得了大約133.9百萬(wàn)條rea

3、ds，總堿基數(shù)為18.13 Gbp。在上vs中、上vs下和中vs下的兩兩比對(duì)中，發(fā)現(xiàn)的DEG數(shù)目分別為3840、3518和3925，并對(duì)其進(jìn)行功能注釋。然后篩選并分析了木質(zhì)化過(guò)程中與細(xì)胞壁代謝相關(guān)的差異基因，得到了編碼纖維素、半纖維素和木質(zhì)素合成途徑中相關(guān)酶基因的表達(dá)特點(diǎn)，并對(duì)其進(jìn)行qRT-PCR驗(yàn)證，qRT-PCR結(jié)果與RPKM值一致。與纖維素和木質(zhì)素合成相關(guān)的基因在下部和中部的表達(dá)量高于上部，這些基因在中下部表達(dá)量的上調(diào)與其較高的木