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文檔簡(jiǎn)介
1、人類基因組全序列測(cè)定的完成標(biāo)志著后基因時(shí)代的到來(lái),生命科學(xué)從基因組序列分析轉(zhuǎn)向基因功能的研究。蛋白質(zhì)組學(xué)是后基因時(shí)代研究中的重要組成部分,雙向凝膠圖像分析技術(shù)是蛋白質(zhì)組學(xué)研究的重要技術(shù),差異蛋白點(diǎn)提取和分析是雙向凝膠圖像分析技術(shù)的核心內(nèi)容,蛋白點(diǎn)匹配又是差異蛋白點(diǎn)提取的關(guān)鍵環(huán)節(jié)。蛋白點(diǎn)匹配算法可用于鑒定潛在差異蛋白質(zhì)分子,能夠?yàn)榧膊≡\斷、藥物研制和環(huán)境污染分析提供依據(jù)。
本論文以凝膠電泳圖像蛋白點(diǎn)為研究對(duì)象,探索凝膠圖像間的蛋
2、白點(diǎn)匹配方法。主要研究工作、成果和創(chuàng)新點(diǎn)如下:
首先,介紹了蛋白組學(xué)的發(fā)展和主要關(guān)鍵技術(shù),概述了本課題的研究背景意義,綜述了凝膠圖像蛋白點(diǎn)匹配方法。
然后,通過(guò)添加 Landmark標(biāo)記點(diǎn)和運(yùn)用近鄰點(diǎn)機(jī)制,提出了基于Landmark的兩凝膠圖像間的蛋白點(diǎn)半自動(dòng)匹配算法。算法通過(guò)采用Landmark區(qū)域劃分法和對(duì)應(yīng)區(qū)域和跨區(qū)域蛋白點(diǎn)匹配提高了算法精度,并從Landmark數(shù)目和圖源兩角度驗(yàn)證了算法的有效性。但此方法為半
3、自動(dòng)方法,需要人工介入。
其次,依據(jù)凝膠電泳圖像蛋白點(diǎn)的分布特征,提出了先特征蛋白點(diǎn)的粗匹配再兩圖像間蛋白點(diǎn)精匹配的自動(dòng)匹配算法。首先采用統(tǒng)計(jì)學(xué)原理計(jì)算匹配距離閾值;然后采用區(qū)域劃分和相似性原理進(jìn)行特征點(diǎn)提取及粗匹配;其次利用匹配到的特征點(diǎn)建立兩圖像間映射關(guān)系;最后實(shí)現(xiàn)兩圖像蛋白點(diǎn)間的精確匹配。通過(guò)真實(shí)凝膠圖像驗(yàn)證了算法的有效性。
最后,從醫(yī)學(xué)分析效果角度,采用了先組內(nèi)兩兩匹配并生成合成膠,再合成膠蛋白點(diǎn)匹配的多幅凝
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