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文檔簡介
1、蛋白質(zhì)如何從一個隨機的無構象的狀態(tài)折疊成它的自然態(tài)是生物學里最基本的問題,通過觀察蛋白質(zhì)折疊的最早期的事件,可以更容易理解蛋白質(zhì)完整的折疊路徑。最長時間的計算機模擬折疊得到的數(shù)據(jù)和最早的實驗所得到的蛋白質(zhì)折疊數(shù)據(jù)存在一定的差別,是因為實驗中存在著一個不能被觀察到的死區(qū)時間,這里我們將介紹一種基于超快微流混合器來研究蛋白質(zhì)折疊的方法,這種方法就不存在這種觀察不到的死區(qū)時間并且該混合器的混合時間比以前最好的實驗儀器得到的死區(qū)時間還要短500
2、倍。我們在這種超快微流體混合器的基礎上,對蛋白質(zhì)折疊的動力學過程通過光學檢測的方式進行研究,得到關于蛋白質(zhì)折疊的相關信息。
本文介紹的超快微流混合器屬于微流聚焦混合器,這種混合器可以克服在高流速驅動下產(chǎn)生的迪恩渦流,也就是說可以實現(xiàn)較大雷諾數(shù)下的流速。這種微流體聚焦混合器采用了層流將蛋白質(zhì)樣品聚焦成一條射流,這條射流只有100納米寬,混合時間很短并且樣品的消耗量很低。采用氣壓驅動的方法驅動容器內(nèi)樣品流動并在微流芯片內(nèi)快速混合,
3、以266nm的激光源激發(fā)實驗樣品(N-乙?;?L-色氨酸胺(NATA)的熒光,并沿著微流芯片的反應通道掃描光信息,通過光電探測器采集光信息,并將掃描位置轉換為時間,得到時間分辨的熒光信號,根據(jù)采集到的熒光光強信息就能得到蛋白質(zhì)折疊的早期數(shù)據(jù)。實驗的結果采用MATLAB語言編程的數(shù)據(jù)處理程序來獲得蛋白質(zhì)折疊信息。
為了實時的得到蛋白質(zhì)折疊動力學的數(shù)據(jù),本論文設計了一套基于超快微流混合器的實驗系統(tǒng),采用LAbVIEW編程語言編寫了
4、圖形化的操作界面,用LabVIEW語言將程序的運行設計成一個虛擬的儀器,方便操作者的使用,該程序設計是以微流混合器的觀察通道為掃描對象,對500微米的觀察通道分別進行6次100*100微米面積的掃描,每次的掃描數(shù)據(jù)都與前一次的數(shù)據(jù)有20微米的重復掃描,這樣可以確保實驗數(shù)據(jù)的完整與正確性。為了能找到微流混合器內(nèi)樣品的射流,我們在物鏡上安裝了行程為100微米的驅動裝置。采用LabVIEW語言作為實驗系統(tǒng)的編程語言,編寫簡單且易操作的蛋白質(zhì)折
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