廣西馬流感病毒A-Equine-GuangXi-1-09(H3N8)的分離鑒定與全基因組序列分析.pdf

1、馬流感(Equine influenza，EI)是由馬流感病毒引起的具有極高傳染性的接觸性急性呼吸道傳染病，是對養(yǎng)馬業(yè)和賽馬業(yè)危害最為嚴(yán)重的傳染病之一，世界動(dòng)物衛(wèi)生組織將其列為B類疫病。本研究運(yùn)用RT-PCR和血清學(xué)方法對從廣西4個(gè)市采集的馬組織樣品和馬血清進(jìn)行H3N8亞型馬流感病毒檢測，共檢測馬血清270份，H3N8亞型陽性3份，陽性率為1.1％；從104份馬組織中檢出1份陽性，陽性率為0.96％；經(jīng)雞胚接種分離到1株病毒，通過血清學(xué)

2、和測序鑒定為H3N8亞型馬流感病毒，命名為A/Equine/GuangXi/1/09(H3N8)。對廣西株8個(gè)基因節(jié)段分別進(jìn)行了擴(kuò)增和序列測定，分析結(jié)果表明，廣西馬流感病毒A/Equine/GuangXi/1/09株HA基因1737bp，編碼569個(gè)氨基酸，核苷酸同源性為77.7％～99.8％，氨基酸同源性為86.5％～99.6％； NA基因1419bp，編碼470個(gè)氨基酸，核苷酸同源性為74.7％～99.5％，氨基酸同源性為80.4％

3、～99.4％； NP基因1508bp，編碼498個(gè)氨基酸，核苷酸同源性為84.7％～99.8％，氨基酸同源性為93.4％～99.6％；M基因1027bp，編碼252個(gè)氨基酸，核苷酸同源性為88.6％～99.9％，氨基酸同源性為96.9％～100％； NS基因945bp，編碼219個(gè)氨基酸，核苷酸同源性為69.4％～99.5％，氨基酸同源性為64.7％～99.5％； PA基因2209bp，編碼716個(gè)氨基酸，核苷酸同源性為91.3％～99

4、.6％，氨基酸同源性為94.4％～99.3％； PB1基因2312bp，編碼757個(gè)氨基酸，核苷酸同源性為92.0％～99.7％，氨基酸同源性為97.1％～99.6％； PB2基因2312bp，編碼759個(gè)氨基酸，核苷酸同源性為92.9％～99.3％，氨基酸同源性為97.1％～99.6％。廣西馬流感病毒分離株HA基因8個(gè)血凝素糖基化位點(diǎn)相對保守，未出現(xiàn)增加或者減少現(xiàn)象，核糖體結(jié)合位點(diǎn)亦非常保守，HA基因ORF全長1710bp，與國內(nèi)外馬