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文檔簡介
1、近年來,超級計(jì)算機(jī)不斷發(fā)展,已成為信息時(shí)代下各國科技實(shí)力的一個(gè)重要體現(xiàn)。然而受限于晶體管物理極限以及當(dāng)前制造工藝水平的限制,CPU的性能發(fā)展已經(jīng)減緩且逐漸無法滿足人們的追求。這種情況下,要達(dá)到更強(qiáng)的計(jì)算性能,一個(gè)可行的方法是不斷的增加計(jì)算集群的規(guī)模。然而,計(jì)算規(guī)模的增大必然導(dǎo)致整個(gè)系統(tǒng)功耗的線性增長。因此從2007年開始,人們開始使用GPGPU進(jìn)行高密度的浮點(diǎn)計(jì)算,協(xié)助CPU進(jìn)行高速運(yùn)算,這種由不同類型運(yùn)算部件構(gòu)成的系統(tǒng)也稱之為異構(gòu)計(jì)算
2、系統(tǒng)。INTEL作為最強(qiáng)的處理器提供廠商,在2012年發(fā)布了先進(jìn)的眾核加速器MIC,迄今為止已經(jīng)得到了較為廣泛的應(yīng)用。
MIC與CPU采用同樣的x86指令集,MIC內(nèi)部運(yùn)行一個(gè)我們稱之為μOS的精簡的Linux系統(tǒng)。因此MIC與CPU的編程模式十分相似,MIC計(jì)算核心可以作為獨(dú)立的計(jì)算節(jié)點(diǎn)參與計(jì)算,與CPU在邏輯上地位相對等。這種MIC應(yīng)用模式我們稱之為對等模式,對等模式下運(yùn)行在CPU和MIC核心上的進(jìn)程之間通過消息傳遞接口(
3、Message-Passing Interface, MPI)進(jìn)行消息傳遞。與運(yùn)行在傳統(tǒng)只由CPU構(gòu)成的計(jì)算系統(tǒng)上的MPI程序類似,MPI通信也會造成不小的程序運(yùn)行開銷。
本文以MIC-CPU對等模式為研究對象,考察程序在對等模式下執(zhí)行時(shí)的通信開銷,并進(jìn)行與其相關(guān)的優(yōu)化研究。主要取得了以下成果:
1.對等模式下,運(yùn)算部件包括CPU和MIC,MIC通過PCI-e接口連接到CPU構(gòu)成計(jì)算節(jié)點(diǎn),集群中各個(gè)計(jì)算節(jié)點(diǎn)通過高速網(wǎng)
4、絡(luò)進(jìn)行互連。而兩個(gè)相互通信的進(jìn)程間可能在整個(gè)集群中的任何兩個(gè)運(yùn)算部件上,通信時(shí)通路的不同帶來通信的復(fù)雜性。本文對MIC-CPU對等模式通信與應(yīng)用的性能展開測試與分析,包括節(jié)點(diǎn)內(nèi)和節(jié)點(diǎn)間CPU+MIC及MIC+MIC等不同組合時(shí)運(yùn)算部件間的通信性能。并測試了對等模式下通信性能對Linpack和NPB執(zhí)行性能的影響;
2.對等模式下程序的實(shí)質(zhì)是MPI程序,而針對MPI程序的優(yōu)化策略包括本地優(yōu)化和全局優(yōu)化。本文首先針對miniMD程
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