基于設(shè)計模式的生物信息存儲研究.pdf

1、隨著越來越多的生物基因(組)的測序完成，生物數(shù)據(jù)不但在數(shù)量上呈指數(shù)增長，存儲及維護(hù)生物數(shù)據(jù)的組織和數(shù)據(jù)庫也越來越多。對生物數(shù)據(jù)的分析與研究是我們的首要目的，但正因為生物數(shù)據(jù)的種類及存儲方式眾多，導(dǎo)致我們在檢索、研究等方面遇到了眾多困難。如何將海量的數(shù)據(jù)按照統(tǒng)一、有效的方式進(jìn)行存儲，已成為當(dāng)前急需解決的問題。同時，隨著后基因時代的來臨，打破傳統(tǒng)的生物信息存儲模式已成為必然。尋找到更好的存儲方式，將為我們更高效地獲得有價值的生物信息提供極大

2、的方便。
　　 生物數(shù)據(jù)存儲的主要問題包括語義異構(gòu)，語法異構(gòu)和模式異構(gòu)等。為了較好的解決以上問題，在研究中結(jié)合了XML在生物信息學(xué)中現(xiàn)階段的應(yīng)用情況，將其作為數(shù)據(jù)的存儲格式及實現(xiàn)存儲模式的媒介。同時，針對本文提出的存儲模式所具有的特點，將XML面向?qū)ο蟮奶匦约{入了研究范圍，使生物信息存儲從信息抽象到數(shù)據(jù)生成均使用統(tǒng)一的信息組織形式。
　　 本文根據(jù)生物數(shù)據(jù)自身的特點，從不同角度對其包含的信息進(jìn)行了分析、抽象以及歸類，形成