關(guān)于有序性狀位點基因定位的再研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、近年來,隨著統(tǒng)計遺傳學的迅猛發(fā)展,人們對尋找合適的定位多個QTL的統(tǒng)計方法的關(guān)注度越來越高.多區(qū)間定位(MIM)法是一種可以同時定位多個QTL與估計上位性的方法,但是這種方法通常都是針對連續(xù)分布的性狀進行研究與應用的.有序性狀的數(shù)據(jù)承載的信息相對較少,因此定位有序性狀的QTL更為復雜.由于這種特殊性,選擇合適的統(tǒng)計學方法把性狀分布考慮在內(nèi)對于定位QTL,尤其是多個QTL十分重要.
  本文中,我們在關(guān)于有序性狀基因定位的研究中考慮

2、多區(qū)間定位法,假設(shè)存在一個叫易患性的潛在響應變量,通過閾值模型將它和有序數(shù)據(jù)聯(lián)系起來,再通過遺傳和統(tǒng)計模型把易患性和QTL基因型聯(lián)系起來,最終建立起一個表達有序數(shù)據(jù)和QTL基因型之間關(guān)系的累積logistic回歸模型.然而,對于這種QTL的區(qū)間定位問題,大多利用的都是全基因組掃描的方法.為使區(qū)間定位更加簡單直接,我們將重組率看作未知參數(shù),通過EM算法同時獲得QTL位置參數(shù)、閾值模型參數(shù)及QTL效應參數(shù)的估計值.本文根據(jù)干擾系數(shù)的不同情況

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