基于LARS方法的FIR陷波濾波器的生物位點(diǎn)預(yù)測(cè).pdf

1、近年來，數(shù)字信號(hào)處理技術(shù)與分子生物學(xué)的結(jié)合產(chǎn)生了生物信息學(xué)的一個(gè)新研究領(lǐng)域。為了處理和分析海量的生物分子數(shù)據(jù)，數(shù)字信號(hào)處理技術(shù)，尤其是數(shù)字濾波器，無疑是一個(gè)非常合適的選擇。在生物序列的位點(diǎn)預(yù)測(cè)這個(gè)熱門領(lǐng)域上，目前主要應(yīng)用的數(shù)字濾波器就是逆切比雪夫?yàn)V波器和IIR陷波濾波器，這兩者都是IIR濾波器。蛋白質(zhì)序列和DNA序列的位點(diǎn)預(yù)測(cè)，是通過對(duì)數(shù)值序列的頻率成分選擇，再由序列峰值對(duì)應(yīng)出序列位置來進(jìn)行的，因此相位信息對(duì)位點(diǎn)預(yù)測(cè)過程來說是非常重要的

2、，任何相位誤差都對(duì)預(yù)測(cè)結(jié)果造成影響。而IIR濾波器雖然容易達(dá)到較高的頻率選擇性能，但相位誤差嚴(yán)重，且不易消除。
　　因此，本文采用一種基于LARS方法的FIR陷波濾波器，對(duì)蛋白質(zhì)熱點(diǎn)和DNA外顯子這兩種生物序列位點(diǎn)進(jìn)行預(yù)測(cè)研究。這種FIR陷波濾波器頻率選擇性非常好，具有嚴(yán)格線性相位，且具有低抽頭數(shù)高性能的優(yōu)點(diǎn)，非常符合生物序列位點(diǎn)預(yù)測(cè)的要求。本文對(duì)LARS FIR陷波濾波器在蛋白質(zhì)熱點(diǎn)預(yù)測(cè)和DNA外顯子預(yù)測(cè)中的應(yīng)用分別進(jìn)行了實(shí)驗(yàn)仿

3、真。為了分析實(shí)驗(yàn)結(jié)果，還仿真了逆切比雪夫?yàn)V波器和IIR陷波濾波器在蛋白質(zhì)熱點(diǎn)和DNA預(yù)測(cè)中的應(yīng)用結(jié)果。經(jīng)過實(shí)驗(yàn)分析證明，基于LARS方法的FIR陷波濾波器，簡(jiǎn)化了蛋白質(zhì)熱點(diǎn)和DNA外顯子預(yù)測(cè)系統(tǒng)的結(jié)構(gòu)，并獲得了很好的預(yù)測(cè)結(jié)果。在蛋白質(zhì)熱點(diǎn)預(yù)測(cè)方面，LARS FIR陷波濾波器的預(yù)測(cè)結(jié)果準(zhǔn)確率達(dá)到了77％。在DNA外顯子方面，更是獲得了遠(yuǎn)高于另外兩種濾波器的預(yù)測(cè)命中率，平均準(zhǔn)確率約88％，同時(shí)減小了預(yù)測(cè)誤差。LARS FIR陷波濾波器在生物