基于雙聚類方法分析基因表達(dá)數(shù)據(jù)的研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、天津師范大學(xué)碩士學(xué)位論文分類編號:——密級:——單位代碼:巡學(xué)號“—13100—90007又滓?guī)熫么髊研究生學(xué)位論文論文題目:基王塑塞婁左法盆撫基國麥達(dá)數(shù)據(jù)的砑宜學(xué)生姓名:寶馥雁申請學(xué)位級別:亟申請專業(yè)名稱:讓箕扭應(yīng)用技本研究方向:生物信息堂指導(dǎo)教師姓名:韭塵強(qiáng)專業(yè)技術(shù)職稱:教援提交論文日期:2Q!墨生曼月天津師范大學(xué)碩士學(xué)位論文隨著人類基因組計(jì)劃的進(jìn)展,對于基因的功能和基因組內(nèi)各基因的研究逐步深入,研究基因在不同時(shí)間和條件下的表達(dá)情況

2、,是認(rèn)識(shí)基因功能的一個(gè)主要途徑。為了確定某個(gè)基因的功能。我們需要捕捉基因表達(dá)過程,這個(gè)過程描述了遺傳信息如何通過轉(zhuǎn)錄和翻譯轉(zhuǎn)換成為功能基因產(chǎn)品。功能基因組學(xué)是通過采用微陣列技術(shù),測試某種條件和環(huán)境的限制下的基因表達(dá)水平,在近幾年的科研領(lǐng)域,微陣列技術(shù)已經(jīng)成為生物研究的主要手段。因此,相應(yīng)的數(shù)據(jù)分析成為生物信息學(xué)的重要工作之一,于是產(chǎn)生了許多探究性統(tǒng)計(jì)方向,包括雙聚類算法。在生物信息學(xué)這一領(lǐng)域中,一個(gè)很關(guān)鍵的問題就是對基因表達(dá)數(shù)據(jù)進(jìn)行雙向

3、聚類,將基因通過在多種不同實(shí)驗(yàn)環(huán)境下的表達(dá)數(shù)據(jù)進(jìn)行雙向的聚類,能夠分析和識(shí)別同一類基因所共同具備的基因功能和轉(zhuǎn)錄調(diào)控元件。本文通過對傳統(tǒng)的聚類方法的闡述,將雙聚類的基本原理作為線索,對其研究現(xiàn)狀進(jìn)行了完整系統(tǒng)的介紹,并且提出了一種新的算法一一ICQUBIC(InformationContentQUBIC),本算法是在QUBIC算法的基礎(chǔ)上進(jìn)行了改進(jìn),引入“信息量”來計(jì)算基因表達(dá)數(shù)據(jù)矩陣的某一行或某一列的一致性,以期使其聚類效果更佳。關(guān)鍵

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