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文檔簡(jiǎn)介
1、多刺蟻屬Polyrhachis隸屬膜翅目Hymenoptera、蟻科Formicidae、蟻亞科Myemicinae,是蟻科中的第二大屬,全世界已描述該屬477種,主要分布于非洲、亞洲、澳大利亞及大洋洲。國(guó)內(nèi)在多刺蟻屬分子系統(tǒng)學(xué)方面的研究幾乎是空白,與發(fā)達(dá)國(guó)家的先進(jìn)水平有較大差距。因此,這方面的研究為建立蟻科正確的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系及螞蟻的有效保護(hù)、利用與防治提供分子生物學(xué)方面的依據(jù),并且對(duì)于積累我國(guó)蟻科昆蟲(chóng)系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)及其基因庫(kù),確立我國(guó)蟻科
2、昆蟲(chóng)系統(tǒng)學(xué)研究在國(guó)際同類研究中的地位有重要意義。本研究通過(guò)降落PCR技術(shù)擴(kuò)增多刺蟻屬10種昆蟲(chóng)的線粒體DNA中的Cytb、COI+COII基因片段,得出各段基因后,利用Clustalx1.83軟件進(jìn)行序列比對(duì),MEGA4進(jìn)行核苷酸組成、氨基酸組成、密碼子使用頻率、堿基替換、遺傳距離等分析,并以弓背蟻屬3種昆蟲(chóng)為外群,基于鄰接法(NJ)、最大簡(jiǎn)約法(MP)及貝葉斯推論法(Bayesian inference,BI)重建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù),從分子水
3、平上對(duì)多刺蟻屬部分種的系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)行了探討,得出以下結(jié)論: 1.多刺蟻屬9種昆蟲(chóng)Cytb基因、5種昆蟲(chóng)COI、COII、COI+COII綜合基因片段都顯示出高A+T含量,分別為71.2%、75.9%、75.0%、75.2%,表現(xiàn)出強(qiáng)烈的A、T偏向性。9種昆蟲(chóng)Cytb基因465bp序列共編碼155個(gè)氨基酸,由19種氨基酸組成,COI基因174bp序列共編碼58個(gè)氨基酸,由17種氨基酸組成,COII基因552bp序列共編碼184個(gè)氨基
4、酸,由20種氨基酸組成,COI+COII綜合基因726bp序列編碼242個(gè)氨基酸,由20種氨基酸組成。這些基因片段中都含有很高含量的苯丙氨酸(Phe)、亮氨酸(Leu)、異亮氨酸(Ile)及絲氨酸(Ser),在氨基酸含量上都表現(xiàn)出一定的偏向性。 2.基于Cytb、COI、COII和COI+COII基因部分序列堿基替換分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)換頻率都大于顛換頻率,轉(zhuǎn)換主要發(fā)生在T與C之間,顛換主要發(fā)生在T與A之間,密碼子第二位點(diǎn)的轉(zhuǎn)換、顛
5、換頻率都比較小,密碼子第三位點(diǎn)的轉(zhuǎn)換和顛換頻率都為最高。 3.基于多刺蟻屬9種昆蟲(chóng)Cytb基因部分序列、5種昆蟲(chóng)COI、COII、COI+COII基因部分序列種間的未校正遺傳距離的分析,可知它們的同源性都很高,同源范圍分別為0.815~0.918、0.862~0.943、0.855~0.962及0.857~0.957。 4.基于多刺蟻屬部分種Cytb、COII、COI+COII基因部分序列的p距離與R值的關(guān)系表現(xiàn)出昆蟲(chóng)線
6、粒體DNA典型的距離依賴性規(guī)律,即距離較近的分類單元之間有較高的R值,而隨著距離的增加,R值呈現(xiàn)下降趨勢(shì)。堿基替換飽和性分析的結(jié)果顯示,基于Cytb、COII、COI+COII基因部分序列轉(zhuǎn)換(Ts)、顛換(Tv)與p距離之間的關(guān)系總體上都呈線性關(guān)系,說(shuō)明了轉(zhuǎn)換、顛換都尚未達(dá)到飽和,但顛換的飽和程度稍大于轉(zhuǎn)換。所有數(shù)據(jù)均包含了較強(qiáng)的系統(tǒng)發(fā)育信號(hào)。 5.對(duì)于Cytb、COI、COII、COI+COII基因,基于DNA序列數(shù)據(jù)采用N
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