基因組中基因非均勻指數(shù)、偏好模以及基因間關(guān)聯(lián)的研究.pdf

1、該文第一章按照"在計算非均勻指數(shù)HI的值時,任何一種堿基在序列中出現(xiàn)的理論頻數(shù)都應(yīng)該大于5"這一基本要求,對原HI公式進行了約化處理,并將約化后的HI值與原HI值作了對比,發(fā)現(xiàn)不同的約化方式所得到的HI值在描述序列不均勻性時的效果是不同的,用編碼區(qū)所偏好的約化語言進行約化后所得到的HI值在應(yīng)用于高GC含量、中GC含量以及總共的外顯子和內(nèi)含子的識別時,其效果要優(yōu)于原HI值.第二章利用重新定義的堿基片段的相對模式含量,研究了大腸桿菌和酵母基

2、因序列的三堿基偏好模.第三章運用信息論的方法,研究了枯草桿菌、大腸桿菌和酵母三種生物的全基因組內(nèi)的基因之間的關(guān)聯(lián)特征.發(fā)現(xiàn)對于大腸桿菌和枯草桿菌基因組來說,基因之間存在著較強的短程關(guān)聯(lián),枯草桿菌基因組在表達水平方面還出現(xiàn)了強度較弱的中、長程關(guān)聯(lián),而且全基因組基因間關(guān)聯(lián)要強于正鏈或負鏈上基因之間的關(guān)聯(lián),基因在表達水平方面的關(guān)聯(lián)要強于在長度方面的關(guān)聯(lián),此外,基因的表達水平和長度這兩個特征間也存在著關(guān)聯(lián),并對這些現(xiàn)象進行了相應(yīng)的解釋.具體到特