鸮形目鳥類線粒體調(diào)控區(qū)序列的測定與比較研究.pdf

1、本論文主要測定了鸮形目四種鳥類的線粒體調(diào)控區(qū)全序列，從比較基因組學(xué)和生物信息學(xué)的角度對鸮形目鳥類線粒體調(diào)控區(qū)的結(jié)構(gòu)進(jìn)行了研究分析，并對鳥類線粒體調(diào)控區(qū)的起源、進(jìn)化、生理功能等進(jìn)行了探討，進(jìn)而研究串聯(lián)重復(fù)序列的起源和進(jìn)化及形成的機(jī)制和生理功能等問題。 利用Long-PCR和Primer-Walking的方法對鸮形目的短耳鸮、長耳鸮、縱紋腹小鸮、灰林鸮四種鳥類的線粒體調(diào)控區(qū)進(jìn)行了全序列測定。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明：短耳鸮的調(diào)控區(qū)長度為3290

2、bp；長耳鸮為2848bp；縱紋腹小鸮為2444bp；灰林鸮為1771bp。短耳鸮的調(diào)控區(qū)長度是四種鸮中最大的，并且是目前已知最大的鳥類線粒體調(diào)控區(qū)。這四種鸮類調(diào)控區(qū)的基本結(jié)構(gòu)和其它鳥類相似，按照堿基變化速率的不同可以分為三個(gè)區(qū)：堿基變化速率較快的外圍區(qū)域Ⅰ、ⅡⅢ和保守的中間區(qū)域Ⅱ。在這三個(gè)區(qū)中均存在一些序列保守的功能框，有些是脊椎動(dòng)物所共有的，有些是鳥類所特有的。這四種鳥類調(diào)控區(qū)的3’端均存在大量的串聯(lián)重復(fù)序列，短耳鸮為126bp單元

3、重復(fù)7次和78bp單元重復(fù)14次，兩段重復(fù)區(qū)之間有99bp間隔；長耳鸮為127bp單元重復(fù)8次和78bp單元重復(fù)6次，重復(fù)區(qū)之間有55bp間隔；縱紋腹小鸮有3個(gè)重復(fù)單元，分別為89bp單元重復(fù)3次、77bp單元重復(fù)4次和71bp單元重復(fù)6次，89bp的重復(fù)單元與77bp重復(fù)單元之間僅有2bp間隔，77bp重復(fù)區(qū)與71bp重復(fù)區(qū)之間有64bp的間隔序列；灰林鸮僅有1個(gè)單元的串聯(lián)重復(fù)為78bp重復(fù)5次。分析表明調(diào)控區(qū)中串聯(lián)重復(fù)序列可能是由鏈