湖光巖瑪珥湖好氧不產(chǎn)氧光合細(xì)菌遺傳多樣性的分析.pdf

1、湖光巖瑪珥湖是一類特殊的火山口湖，它完全封閉，地質(zhì)年代久遠(yuǎn)，尚未受人類活動的劇烈影響，蘊(yùn)育著豐富而特殊的微生物種群。因此研究和開發(fā)湖光巖瑪珥湖的微生物資源具有相當(dāng)高的價(jià)值。好氧不產(chǎn)氧光合細(xì)菌(AAPB)是以其在有氧情況下能行駛光合功能而定義的一類專性異養(yǎng)細(xì)菌，其生理生態(tài)特征獨(dú)特，進(jìn)化年代久遠(yuǎn)，在水生生態(tài)系統(tǒng)上層水體中廣泛分布。目前，AAPB在瑪珥湖水體中是否有分布仍是未知。
　　本論文選取了湖光巖水體最深的位點(diǎn)，通過四個不同時期采

2、集1m(表層)、5m(中間層)和12m(近底層)的水樣進(jìn)行分析。提取浮游總菌的總DNA和RNA，并擴(kuò)增編碼光反應(yīng)中心的小亞基pufM基因和大亞基pufL，基因，通過構(gòu)建克隆文庫和測序分析，研究AAPB在湖光巖瑪珥湖的生態(tài)分布及系統(tǒng)發(fā)育多樣性。同時結(jié)合定量PCR技術(shù)，分析了AAPB在湖光巖瑪珥湖浮游總細(xì)菌中的相對豐度。
　　研究結(jié)果表明，湖光巖瑪珥湖中AAPB有很高的多樣性。對比pufM基因的DNA序列和RNA序列，可知pufM基因

3、RNA的多樣性高于DNA。這說明對該基因的RNA研究有利于拓寬AAPB在湖光巖中多樣性的研究。根據(jù)系統(tǒng)發(fā)育分析結(jié)果表明，湖光巖瑪珥湖中AAPB類群的優(yōu)勢菌與β-Proteobacteria的進(jìn)化距離最近。其中湖光巖瑪珥湖含有一定數(shù)量的與不可培養(yǎng)類群相似的AAPB，同時也存在著湖光巖獨(dú)有的AAPB種屬。各水層的AAPB多樣性亦不一樣，這可能與季節(jié)、水溫、光照強(qiáng)度、紫外光輻射等多種環(huán)境因子的影響有關(guān)?？赡苡捎趐ufL基因較pufM基因更為保