單基因擾動的自適應(yīng)灰關(guān)聯(lián)聚類算法.pdf

1、隨著人類基因組計劃的完成，對基因功能的揭示成為后基因組時代的研究熱點。而基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的研究正是從全局的變化中探索基因功能，研究基因之間的相互調(diào)控表達(dá)關(guān)系。 研究基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的方法一般包括計算機(jī)方法和生物學(xué)方法。計算機(jī)方法包括聚類分析建立模型和通過“逆向工程”方法推斷基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。其中聚類方法使用廣泛，且已有方法較多，通過聚類找出具有相似功能，表達(dá)模式也相似的基因集合，這是研究基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的有效的重要得方法之一。 生物學(xué)方

2、法一般使用基因擾動實驗，它通過操縱一個基因或其產(chǎn)物來控制基因活動，從中獲得基因相互調(diào)控關(guān)系的信息，從而重構(gòu)基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。由于生命組織的基因組規(guī)模巨大，而單個基因擾動一般需要1-3個月，且花費(fèi)高昂，因此單基因擾動實驗的對象一般為局部組織。單基因擾動實驗采取全基因擾動方法，即每個參與實驗的基因都進(jìn)行一次擾動，一旦選取的實驗基因數(shù)量過大，而其中存在一些對于構(gòu)建基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)沒有太大影響的基因，就會造成實驗成本的不必要上升和實驗周期的無端增加。因