細(xì)菌基因組中脂類代謝的比較.pdf

1、脂類是生物體內(nèi)一大類重要的有機(jī)化合物，行使重要的生物學(xué)功能。但是長(zhǎng)期以來(lái)，人們對(duì)脂類代謝的研究主要集中在動(dòng)物，所用方法也多是實(shí)驗(yàn)方法，而對(duì)于細(xì)菌脂類代謝的研究相對(duì)較少，且研究也大多局限于對(duì)單個(gè)細(xì)菌的脂類合成與分解的某個(gè)蛋白或基因的分析。針對(duì)這一問(wèn)題，我們采用基因組分析的方法，統(tǒng)計(jì)比較了不同類型細(xì)菌基因組中脂類代謝相關(guān)酶的差異。由于在國(guó)際公共數(shù)據(jù)庫(kù)中已有的基因組注釋信息依然存在很多問(wèn)題，我們首先對(duì)選取細(xì)菌的基因組進(jìn)行了重新注釋；將重新注釋

2、過(guò)的131種細(xì)菌按照革蘭氏屬性、最適生長(zhǎng)溫度和對(duì)氧氣需求的不同進(jìn)行分類。從基因的水平上，統(tǒng)計(jì)每種脂類代謝相關(guān)酶在不同類型細(xì)菌中的分布，比較不同類型細(xì)菌脂類代謝的差異，并對(duì)差異做進(jìn)一步討論與分析。
　　通過(guò)對(duì)細(xì)菌基因組中脂類代謝相關(guān)酶的統(tǒng)計(jì)分析，發(fā)現(xiàn)不同類型的細(xì)菌脂類代謝主要存在以下差異：
　?。?）厭氧細(xì)菌主要通過(guò)不飽和脂肪酸鏈的延伸合成不飽和脂肪酸，而好氧細(xì)菌主要通過(guò)長(zhǎng)鏈脂肪酸的脫氫合成不飽和脂肪酸；
　?。?）不飽

3、和脂肪酸合成酶主要存在于低溫和中溫細(xì)菌中，在高溫細(xì)菌中很少存在；
　　（3）負(fù)責(zé)起始脂肪酸合成和初期脂肪酸鏈延長(zhǎng)的3-酮?；?ACP合成酶III在細(xì)菌中廣泛存在，而在高溫細(xì)菌中主要通過(guò)3-酮?；?ACP合成酶II負(fù)責(zé)后續(xù)脂肪酸鏈的延長(zhǎng)，在中溫和低溫細(xì)菌中主要通過(guò)3-酮?；?ACP合成酶 I負(fù)責(zé)后續(xù)脂肪酸鏈的延長(zhǎng)；
　?。?）革蘭氏陽(yáng)性細(xì)菌也可以通過(guò)存在于哺乳動(dòng)物中的甲羥戊酸途徑來(lái)合成異戊烯焦磷酸；
　　（5）細(xì)菌主要通