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文檔簡(jiǎn)介
1、多序列比對(duì)是現(xiàn)代生物信息學(xué)研究領(lǐng)域非常重要的核心問題。為了能夠比對(duì)多種相近物種之間的多條序列，我們迫切需要一種多序列比對(duì)工具。當(dāng)前序列比對(duì)的研究主要集中于基因組雙序列比對(duì)，而有效的多序列比對(duì)算法只有少數(shù)幾個(gè)，而其中被公認(rèn)為經(jīng)典的軟件要屬CLUSTAL。
本文對(duì)CLUSTAL程序中的算法做了詳盡的研究。CLUSTAL算法主要分為三個(gè)步驟：兩兩比對(duì)，構(gòu)建向?qū)浜蜐u進(jìn)比對(duì)，本文主要對(duì)其算法中的第一步與第二步提出了一種有效的優(yōu)化算法。
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