應(yīng)用mtDNA CytB基因全序列分析白唇鹿和五個馬鹿亞種的遺傳多樣性與系統(tǒng)進化.pdf

1、本研究以白唇鹿、甘肅馬鹿、青海馬鹿、天山馬鹿、東北馬鹿和塔里木馬鹿為研究對象，根據(jù)鹿線粒體DNA CytB全序列，結(jié)合生物信息學方法，檢測了白唇鹿和五個馬鹿亞種的線粒體細胞色素B基因全序列的多態(tài)性，旨在分子水平上探討中國白唇鹿和五個馬鹿亞種的遺傳多樣性和系統(tǒng)進化，為鹿品種遺傳資源的保護和利用提供科學理論依據(jù)。 本研究采用clustalX軟件進行同源序列比對；Dnasp4.10軟件用于遺傳多樣性分析、計算單倍型多樣度、核苷酸多樣

2、度；MEGA4.0軟件采用鄰接法和最小進化法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹，并進行系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系分析；NETWORK軟件用于網(wǎng)絡(luò)關(guān)系分析，對中國白唇鹿和五個馬鹿亞種的51個個體的mtDNA CytB基因全序列進行測序分析，并以黃占線粒體基因組為對照(Genbank登錄號為AJ000022)，結(jié)果表明：塔里木馬鹿與甘肅馬鹿、青海馬鹿親緣關(guān)系最遠，塔里木馬鹿與東北馬鹿較近，與天山馬鹿最近；天山馬鹿與甘肅馬鹿、青海馬鹿親緣關(guān)系較近，與東北馬鹿較遠；甘肅馬鹿和青

3、海馬鹿是同一個DNA類型。白唇鹿、天山馬鹿、塔里木馬鹿的遺傳多樣性較豐富，甘肅馬鹿、青海馬鹿、東北馬鹿的遺傳多樣性較貧乏。 同時，引用Genbank已登錄的41條序列，包括非洲馬鹿4個(登錄號：AY070222、AY118198、AY244489)，東亞馬鹿2個(登錄號：AY070224、AY244490)，西歐馬鹿10個(登錄號：AY070226、AY070221、AY044859、AY244491、AF489281、AY0

4、44858、AY044-860、AB021099、AY070226、AY148966)，中東馬鹿3個(登錄號：AY118199、AF489280)，北亞/北美馬鹿4個(AF423198、AB021096、AY044862、AF423199)，梅花鹿5個(登錄號：AB021092～AB021094、AY035876、AB021095，南亞馬鹿3個(登錄號：AY035875、AY070223、AY044861)，水鹿3個(登錄號：AY035

5、874、AF423200、AF423201)，巴爾干馬鹿7個(登錄號：AY044857、AF423195、AF423196、AF489279、AY118197、AY070225)，17個單倍型結(jié)合41條引用的序列信息，分別構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹和網(wǎng)絡(luò)親緣關(guān)系分析，結(jié)果表明：塔里木馬鹿與西方馬鹿群體遺傳距離(0.044)和東方馬鹿群體遺傳距離(0.059)比較，說明塔里木馬鹿與西方馬鹿系統(tǒng)的親緣關(guān)系更近。梅花鹿與馬鹿的遺傳距離(0.040)較近，