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文檔簡介
1、背景:
有研究表明生命早期經歷能量缺乏可以降低結直腸癌的發(fā)生的幾率,其中涉及了表觀遺傳學的改變,主要是對CpG島甲基化表型(CpGislandmethylatorphenotype,CIMP)的狀態(tài)產生影響,而同時有研究顯示,腸道微生態(tài)的結構變化對患者表觀遺傳學存在一定的影響,其能通過某些機制使表觀遺傳學在人體生長發(fā)育過程中發(fā)生改變。
目的:
本研究旨在觀察生命早期能量缺乏對結直腸癌患者的臨床病理學特征及預
2、后的影響,并探討微生態(tài)、微衛(wèi)星不穩(wěn)定及表觀遺傳學等變化在這一過程中所起到的作用。
方法:
收集1956年~1964年間出生的結直腸癌患者根據(jù)其出生時間的不同進行分組,腫瘤標本進行DNA提取,并對DNA進行16SrDNA的V1-V3高可變區(qū)高通量測序,使用主坐標分析法、聚類分析和kruskal-wallis秩和檢驗分析其腸道微生態(tài)分布的多樣性及物種豐度的改變。同時,我們隨機在三組中抽取標本,合計60個,使用熒光PCR進
3、行BRAF突變的檢測,使用毛細管電泳法配合RT-PCR進行微衛(wèi)星不穩(wěn)定(MSI)狀態(tài)的測定,同時,使用甲基化MSP檢測(Methylation Specific PCRDetection)進行CpG島甲基化表型(CpGislandmethylatorphenotype,CIMP)檢測。統(tǒng)計學使用t檢驗以及卡方檢驗驗證患者臨床病理學資料以及分子表型與微生態(tài)之間的相關性。同時應用雙模表示展示在CIMP中MSI和BRAF突變的狀態(tài)。應用Kap
4、lan-Meier法對三組人群之間的生存率進行分析,了解上述的這一些變化是否會對生存產生不同的影響,以評估能量變化對人體造成的影響。
結果:
我們發(fā)現(xiàn)在不同的組之間在CRC的位置(P=0.034)和CEA水平(P=0.036)以及居住地區(qū)的不同(P=0.007)顯示出其存在統(tǒng)計學上的差異。同時,三組人群的生存比較發(fā)現(xiàn),相較于非饑荒組,饑荒組的人群5年總生存率高于非饑荒組(OS:68.8%vs64.2%/62.1%)而
5、在高通量測序顯示在所有檢測的標本中,我們可以發(fā)現(xiàn)具核梭桿菌,脆弱擬桿菌和大腸桿菌在饑荒前組和饑荒后組中豐度較高,而普雷沃氏菌菌在饑荒組中顯示更高的豐度,兩者的差異情況主要在,其中主要在β多樣性中產生。觀察到BRAF高突變頻率以及高程度的微衛(wèi)星不穩(wěn)定較易出現(xiàn)在高程度的CIMP中。脆弱擬桿菌的豐度值與BRAF突變程度存在相關性,大腸桿菌與MSI的突變相關。此外,聚合梭桿菌與CIMP和MSI的狀態(tài)存在相關性。
結論:
生命
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