RNA-蛋白質(zhì)復(fù)合物結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè).pdf

1、RNA-蛋白質(zhì)相互作用在許多生命活動(dòng)中有著至關(guān)重要的作用，如基因調(diào)控，RNA剪切和蛋白質(zhì)合成。高精度的RNA-蛋白質(zhì)復(fù)合體結(jié)構(gòu)能夠幫助深入的理解這些生命過(guò)程。但是，實(shí)驗(yàn)方法來(lái)解析RNA-蛋白質(zhì)復(fù)合體結(jié)構(gòu)十分繁瑣，而且需要耗費(fèi)大量的時(shí)間和金錢(qián)。因此，通過(guò)理論的方法來(lái)預(yù)測(cè)RNA-蛋白質(zhì)復(fù)合體結(jié)構(gòu)就變得尤為重要。目前，基于理論的RNA-蛋白質(zhì)預(yù)測(cè)方法還比較少。針對(duì)上述問(wèn)題，提出了一套R(shí)NA-蛋白質(zhì)復(fù)合體結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè)方法3dRPC，其中包括RNA

2、-蛋白質(zhì)對(duì)接方法RPDOCK和RNA-蛋白質(zhì)打分方法DECK-RP。
　　本文的主要內(nèi)容如下：
　　1，RNA-蛋白質(zhì)對(duì)接方法的研究。本文提出了一個(gè)基于快速傅里葉變換的RNA-蛋白質(zhì)對(duì)接方法RPDOCK。在對(duì)接中充分考慮了RNA-蛋白質(zhì)相互作用的幾個(gè)特征：首先，RNA-蛋白質(zhì)相互作用界面與蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用界面在原子堆積上不同；其次，靜電在RNA-蛋白質(zhì)相互作用中有非常重要的作用；最后，堿基和芳香族側(cè)鏈之間的堆積效應(yīng)在R