鰱中國(guó)本土群體與歐美移居群體遺傳差異分析.pdf

1、一、鰱中國(guó)本土群體與歐美移居群體遺傳差異的線粒體序列分析
　　 鰱是中國(guó)本土魚類，作為重要的養(yǎng)殖對(duì)象，已經(jīng)被引進(jìn)到八十多個(gè)國(guó)家或地區(qū)，并已在一些大型河流中建群。但是目前對(duì)鰱本土群體與移居群體之間的遺傳差異和遺傳多樣性的研究尚未見報(bào)道。在本研究中，我們采集了國(guó)內(nèi)（長(zhǎng)江，珠江和黑龍江）和國(guó)外（美國(guó)密西西比河和匈牙利多瑙河）的鰱241個(gè)樣本。通過線粒體D-Loop區(qū)和COI基因序列分析，共發(fā)現(xiàn)單倍型72個(gè)。其中2-4個(gè)群體共享單倍型8

2、個(gè)，未發(fā)現(xiàn)五個(gè)群體共享的單倍型。所有的共享單倍型都是長(zhǎng)江群體與其他群體共享，因此推測(cè)鰱源于長(zhǎng)江水系。國(guó)外移居群體的單倍型多樣性和核苷酸多樣性均低于本土群體，可能是奠基者效應(yīng)。遺傳分化指數(shù)(FST)顯示美國(guó)群體與其他群體有顯著的遺傳差異，更接近長(zhǎng)江群體和黑龍江群體，多瑙河群體則與長(zhǎng)江群體和珠江群體更接近。分子方差分析表明本土群體與移居群體之間存在著顯著的遺傳差異。盡管引進(jìn)的群體數(shù)量很小，但是移居群體發(fā)生了顯著的遺傳變異：對(duì)鰱進(jìn)化演變的觀察

3、啟示，當(dāng)魚類被引入環(huán)境大不相同的新水域時(shí)所遭受的強(qiáng)大壓力，可能會(huì)加速進(jìn)化的遺傳分化率。
　　 二、鰱中國(guó)本土群體與歐美移居群體遺傳差異的微衛(wèi)星分析
　　 采用磁珠富集法開發(fā)鰱微衛(wèi)星，共測(cè)序陽性克隆77個(gè)，46個(gè)序列中含有微衛(wèi)星，富集效率達(dá)到59.74％。共得到微衛(wèi)星序列73個(gè)，其中重復(fù)數(shù)大于10的有57個(gè)，占78.08％，重復(fù)數(shù)大多在18左右：完美形的有31個(gè)，占42.4％。設(shè)計(jì)合成引物28對(duì)，通過檢測(cè)，有20對(duì)引物可以

4、擴(kuò)增出條帶，有多態(tài)性的有15對(duì)。采用17個(gè)微衛(wèi)星分子標(biāo)記，對(duì)中國(guó)本土群體（長(zhǎng)江、珠江和黑龍江群體）和國(guó)外移居群體（美國(guó)密西西比河和匈牙利多瑙河群體）進(jìn)行了遺傳多樣性分析，計(jì)算并統(tǒng)計(jì)了平均有效等位基因數(shù)、平均觀測(cè)等位基因數(shù)、多態(tài)信息含量、遺傳距離、遺傳分化指數(shù)等遺傳參數(shù)。同時(shí)。根據(jù)Nei氏標(biāo)準(zhǔn)遺傳距離構(gòu)建NJ聚類圖。結(jié)果顯示：在鰱的14個(gè)國(guó)內(nèi)采樣外群體中，各位點(diǎn)平均等位基因數(shù)變化范圍為2.47～5.24，平均有效等位基因數(shù)變化范圍為2.4

5、7～3.48，平均觀測(cè)雜合度為0.3088～0.5000，平均期望雜合度為0.4664～0.6606，平均多態(tài)信息含量為0.430～0.605，表明14個(gè)群體為中度多態(tài)，而國(guó)內(nèi)群體遺傳多樣性高于國(guó)外群體。通過群體間遺傳分化指數(shù)和遺傳距離比較顯示：群體間成對(duì)FST值范圍為0.0293～0.1109，各群體間均存在程度不同的遺傳分化。珠江群體與各群體的遺傳距離均較大(0.1214～0.1540)，長(zhǎng)江群體與美國(guó)群體的遺傳距離最小，為0.04