18583.卡律蝎毒素(chtx)結(jié)構(gòu)和性質(zhì)的從頭算和abeemσπ的研究

1、分類號：密級：學(xué)校代碼：學(xué)號：遣掌研耗大學(xué)10165201211000934碩士學(xué)位論文卡律蝎毒素(ChTX)結(jié)構(gòu)和性質(zhì)的從頭算和ABEEM硎勺研究作者姓名：學(xué)科、專業(yè)：研究方向：導(dǎo)師姓名：曹軍物理化學(xué)理論與計算化學(xué)趙東霞教授20l5年4月遼寧師范大學(xué)碩士學(xué)位論文摘要肽攔截體與離子通道之間進(jìn)行的分子識別是包含了許多反應(yīng)的復(fù)雜過程。本文選取卡律蝎毒(ChTX)蛋白和6個突變體及其活性區(qū)域氨基酸殘基以及一些類似殘基側(cè)鏈的小分子體系作為模型分

2、子，并對這些模型分子進(jìn)行活性指標(biāo)的理論研究?？尚?ChTX)蛋白和6個突變體及其活性區(qū)域氨基酸殘基體系均采用實(shí)驗(yàn)結(jié)構(gòu)，類似殘基側(cè)鏈的小分子采用B3LYP／63llG(d，p)方法，在Gaussian09程序中優(yōu)化所獲得的結(jié)構(gòu)。使用線性回歸和最小二乘法，擬合了這些模型分子中所涉及的ABEEMtrlt參數(shù)(價態(tài)電負(fù)性和價態(tài)硬度)。采用我們所調(diào)試的的參數(shù)，ABEEMtrzD亨法所算得的這些體系的電荷分布與HF／STO3G從頭算方法所計算的

3、Mulliken電荷分布的線性方程的斜率接近107，截距接近于0001，線性相關(guān)系數(shù)在096以上。表明ABEEMcr；r蔓j“法與從頭算方法所計算的電荷結(jié)果具有很好的一致性，驗(yàn)證了我們所擬合的ABEEMtrn參數(shù)是合理的和可轉(zhuǎn)移的，可應(yīng)用于類似體系的電荷分布的計算。采用量子化學(xué)方法和ABEEMtrz))法計算了ChTX和6個突變體蛋白質(zhì)模型分子的整體軟度和整體親電性。利用Hammett關(guān)系式，計算有關(guān)整體軟度和整體親電性的Hammett

4、系數(shù)，探討了該系數(shù)與卡律蝎毒素與鉀離子通道間的解離常數(shù)鋤的關(guān)系。獲得了ChTX以及它的6個突變體對鉀離子通道吸引力的定性描述：整體軟度與ChTX的靜電吸引能力有一定聯(lián)系，ChTX和6個突變體蛋白質(zhì)的整體軟度越大，蛋白質(zhì)與鉀離子通道問的解離常數(shù)越?。灰吧投舅氐恼w軟度最大其對應(yīng)的解離常數(shù)最小，說明在鉀離子通道與ChTX的識別過程中，野生型毒素特有氨基酸對解離常數(shù)七哆的影響很大。應(yīng)用ABEEMtrot)If法能夠計算出卡律蝎毒(ChTX)