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文檔簡(jiǎn)介
1、鲇( Silurus asotus)、粗唇鮠(Leiocassis crassilabris)和斑鱯( Hemibagrus guttatus)均隸屬鲇形目(Siluriformes),且均為我國(guó)重要淡水經(jīng)濟(jì)魚類。近年來(lái),該3種魚類在貴州都柳江受到了高強(qiáng)度的捕撈,加之水環(huán)境污染和水利工程等造成的魚類棲息環(huán)境破壞,其野生資源量日趨減少,而物種的遺傳多樣性與其適應(yīng)能力、生存能力密切相關(guān)。目前,尚無(wú)有關(guān)都柳江鲇、粗唇鮠和斑鳠野生種群遺傳多樣性
2、研究的報(bào)道,因此,本研究以都柳江該3種魚類種群為研究對(duì)象,采用PCR和DNA測(cè)序技術(shù)研究了該3種魚類線粒體DNA Cyt b基因和D-loop序列組成及遺傳多樣性,進(jìn)行其種質(zhì)的遺傳學(xué)評(píng)價(jià),以期為開展都柳江該3種經(jīng)濟(jì)魚類種質(zhì)資源的利用及保護(hù)提供科學(xué)依據(jù)。主要結(jié)果如下:
1、以采自都柳江39尾鲇個(gè)體為樣品,采用PCR和DNA測(cè)序技術(shù)對(duì)都柳江鲇種群Cyt b基因和D-loop序列進(jìn)行了分析。獲取了長(zhǎng)度為1122 bp和D-loop5
3、′端長(zhǎng)度為544~545 bp的鲇Cyt b基因、D-loop序列。在Cyt b基因中,檢測(cè)到46個(gè)多態(tài)位點(diǎn),變異多發(fā)生在密碼子第3位點(diǎn),且多為同義突變。4種堿基在密碼子上分布上具有明顯的偏倚性。在D-loop序列中,檢測(cè)到58個(gè)變異位點(diǎn),其中多態(tài)位點(diǎn)51個(gè)。對(duì)鲇D-loop序列結(jié)構(gòu)進(jìn)行了分析,識(shí)別了鲇D-loop終止序列區(qū)和中央保守區(qū)等的特征序列。
2、都柳江鲇種群Cyt b基因、D-loop序列中,分別有46、51個(gè)多態(tài)位
4、點(diǎn),均定義了11種單倍型。都柳江鲇種群Cyt b基因和D-loop序列的單倍型多樣性指數(shù)和核苷酸多樣性指數(shù)分別為0.646、0.00899和0.772、0.02301?;贒-loop序列的都柳江鲇種群遺傳多樣性水平較Cyt b基因的要高。都柳江鲇種群大小穩(wěn)定,具有較豐富的遺傳多樣性。
3、本研究中,獲取了都柳江40尾粗唇鮠Cyt b基因和D-loop長(zhǎng)度分別為1118 bp和776~778 bp的序列。在Cyt b基因中,檢
5、測(cè)到3個(gè)多態(tài)位點(diǎn),變異多發(fā)生在密碼子第3位點(diǎn),且多為同義突變。4種堿基在密碼子上分布上具有明顯的偏倚性。在D-loop序列中,檢測(cè)到26個(gè)變異位點(diǎn),其中多態(tài)位點(diǎn)20個(gè)。對(duì)粗唇鮠D-loop序列結(jié)構(gòu)進(jìn)行了分析,識(shí)別了粗唇鮠D-loop終止序列區(qū)、中央保守區(qū)和保守序列區(qū)等的特征序列。
4、都柳江粗唇鮠種群Cyt b基因、D-loop序列中,分別有3、20個(gè)多態(tài)位點(diǎn),且分別定義了4、10種單倍型。都柳江粗唇鮠種群Cyt b基因和D-
6、loop序列的單倍型多樣性指數(shù)和核苷酸多樣性指數(shù)分別為0.146、0.00013和0.404、0.00317。基于D-loop序列的都柳江粗唇鮠種群遺傳多樣性水平較Cyt b基因的要高。都柳江粗唇鮠種群遺傳多樣性較低。
5、獲得了都柳江39尾斑鱯Cyt b基因長(zhǎng)度為1122 bp和D-loop5′端長(zhǎng)度為546~547 bp的序列。在Cyt b基因中,檢測(cè)到15個(gè)多態(tài)位點(diǎn),變異多發(fā)生在密碼子第3位點(diǎn),且多為同義突變。4種堿基在
7、密碼子上分布上具有明顯的偏倚性。在D-loop序列中,檢測(cè)到15個(gè)變異位點(diǎn),其中多態(tài)位點(diǎn)12個(gè)。對(duì)斑鱯D-loop序列結(jié)構(gòu)進(jìn)行了分析,識(shí)別了斑鱯D-loop終止序列區(qū)和中央保守區(qū)等的特征序列。
6、都柳江斑鱯種群Cyt b基因、D-loop序列中,分別有15、12個(gè)多態(tài)位點(diǎn),且分別定義了10、8種單倍型。都柳江斑鱯種群Cyt b基因和D-loop序列的單倍型多樣性指數(shù)和核苷酸多樣性指數(shù)分別為0.610、0.00101和0.33
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