肥尾和瘦尾羊全基因組選擇信號(hào)檢測(cè).pdf

1、選擇信號(hào)是生物在人工或自然選擇過程中，由于選擇作用在基因組上留下的選擇印跡，通常情況下表現(xiàn)為染色體長(zhǎng)范圍的連鎖不平衡或者遺傳多態(tài)性的降低。為研究不同尾型綿羊群體遺傳分化程度，檢測(cè)全基因組選擇信號(hào)，以挖掘與不同尾型綿羊重要性狀相關(guān)的候選基因。本研究基于蒙古羊（短脂尾）和藏羊（瘦尾）群體的Illumina Ovine SNP50K芯片分型數(shù)據(jù)，借助遺傳分化系數(shù)FST法進(jìn)行群體間選擇信號(hào)檢測(cè)分析，應(yīng)用生物信息學(xué)方法分析尋找選擇信號(hào)區(qū)域內(nèi)的重要

2、基因，并對(duì)其中與脂肪代謝相關(guān)的基因PPARG、 PDGFD在呼倫貝爾羊（大尾和小尾品系;肥尾）與藏羊（瘦尾）尾脂進(jìn)行mRNA相對(duì)表達(dá)量研究。
　　結(jié)果如下:(1)465個(gè)SNPs受選擇，通過基因注釋找到448個(gè)候選基因，GO功能富集分析表明這些基因主要富集在發(fā)育過程、細(xì)胞形態(tài)建成、大分子分解代謝等條目;并在這些候選基因中篩選出50個(gè)與脂類代謝相關(guān)的基因，GO功能富集分析發(fā)現(xiàn)這些基因主要富集在脂類生物合成過程、磷脂代謝、脂質(zhì)結(jié)合等條

3、目，此外發(fā)現(xiàn)4個(gè)基因(PPARG、 PXRG、 SLC27A2和ACSL6)富集到PPAR信號(hào)通路。PPARG和PDGFD作為候選基因參與了脂肪代謝過程，可能與尾脂形成有重要關(guān)系。(2)對(duì)脂肪代謝合成相關(guān)重點(diǎn)候選基因PPARG和PDGFD進(jìn)行尾脂組織相對(duì)表達(dá)量研究表明:肥瘦尾之間，呼倫貝爾羊（大尾和小尾品系）PPARG和PDGFD基因表達(dá)量均顯著高于藏羊（P＜O.01)，而大小肥尾之間，呼倫貝爾羊大尾品系PPARG基因表達(dá)量顯著高于小尾